Avís important
La guia docent és provisional.
La versió en PDF de la guia docent pot tardar uns dies en estar disponible al DDD.
Anatomia i Patobiologia del Ratolí
Codi: 45023Crèdits: 10
| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| Erasmus Mundus Master in Human Disease Models Morphological Phenotyping | OB | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom :
- Jesús Ruberte Paris
- Correu electrònic :
- jesus.ruberte@uab.cat
Equip docent
- Ana Carretero Romay
- Marc Navarro Beltran
- Jesús Ruberte Paris
- Víctor Nacher Garcia
Equip docent (extern a la UAB)
- Paolo de Girolamo
- Livia d'Angelo
- Luísa Mendes-Jorge
- Anastasia Tsingotjidou
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Un títol universitari en els àmbits de Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Farmàcia, Veterinària o Medicina. Es requereix acreditar el domini de la llengua anglesa, amb un nivell mínim C1 del Marc Comú Europeu de Referència per a les Llengües.
Objectius
- Comprendre la genètica bàsica del ratolí i els mecanismes que controlen els processos embrionaris.
- Conèixer l’etiologia i el significat de les anomalies del desenvolupament.
- Reconèixer i comprendre la forma, l’estructura, la disposició i les relacions dels òrgans i sistemes del ratolí.
- Identificar microscòpicament els teixits i òrgans del ratolí.
- Utilitzar correctament i de manera apropiada la terminologia embriològica, anatòmica i histològica.
- Integrar la morfologia del ratolí a través dels nivells orgànic, cel·lular i subcel·lular.
- Comprendre els principis fonamentals de la patologia general.
- Identificar alteracions estructurals dels òrgans mitjançant histologia i immunohistoquímica per correlacionar-les amb processos patològics específics.
Resultats d'aprenentatge
- CM01 (Ser capaç d'integrar la morfologia del ratolí a través dels nivells orgànic, cel·lular i subcel·lular.) Ser capaç d'integrar la morfologia del ratolí a través dels nivells orgànic, cel·lular i subcel·lular.
- CM02 (Ser capaç de correlacionar les alteracions estructurals dels òrgans del ratolí amb processos patològics específics.) Ser capaç de correlacionar les alteracions estructurals dels òrgans del ratolí amb processos patològics específics.
- KM01 (Conèixer els mecanisme que controlen els processos embrionaris.) Conèixer els mecanisme que controlen els processos embrionaris.
- KM02 (Reconèixer l'etiologia i el significat de les anomalies del desenvolupament.) Reconèixer l'etiologia i el significat de les anomalies del desenvolupament.
- KM03 (Identificar i comprendre la forma, estructura, disposició i relacions dels òrgans i sistemes del ratolí.) Identificar i comprendre la forma, estructura, disposició i relacions dels òrgans i sistemes del ratolí.
- KM04 (Identificar els teixits i òrgans del ratolí microscòpicament.) Identificar els teixits i òrgans del ratolí microscòpicament.
- KM05 (Comprendre els principis fonamentals de la patologia.) Comprendre els principis fonamentals de la patologia.
- KM06 (Identificar alteracions estructurals d'òrgans mitjançant la histologia i la immunohistoquímica.) Identificar alteracions estructurals d'òrgans mitjançant la histologia i la immunohistoquímica.
- SM01 (Fer servir la terminologia anatòmica, embriològica, histològica i patològica de forma correcta.) Fer servir la terminologia anatòmica, embriològica, histològica i patològica de forma correcta.
- SM02 (Dur a terme la dissecció i la necròpsia d'un ratolí de forma correcta.) Dur a terme la dissecció i la necròpsia d'un ratolí de forma correcta.
Continguts
|
|
|
|
|
Erasmus Mundus Joint Master in
Human Diseases Models
Morphological Phenotyping
(MorphoPHEN)
Teaching Programme 2026-2027
| MODULE I – Mouse Anatomy and Pathobiology |
|
|
| Monday, September 7th | ||
| 9.30 – 10.00 | Introductory remarks | J. Ruberte and E. Gea |
| 10.00 – 11.00 | General concepts in morphological mouse phenotyping | J. Ruberte |
| 11.00 – 11.30 | Legal information for international students | M. Lluís |
| 11: 30 – 12:00 | Active pause - Servei d'Activitat Física (SAF) | |
| 12:00 – 12:15 | Introduction to Module I – Mouse Anatomy and Pathobiology | J. Ruberte |
| 12:15 – 12:30 | Introduction to Module II – Mouse Imaging | J. Ruberte |
| 12:30 – 12:45 | Introduction to Module III – Experimental Design and Deep Learning | E. Gea |
| 12:45 – 13:00 | Introduction to the Master’s Degree Internship | E. Gea |
| 13:00 – 14:00 | GRADUATION |
| Tuesday, September 8th | |||
| 9.00 – 10 | Comparative Mouse vs Human Anatomy | J. Ruberte | |
| 10 – 11 | Animal transgenesis: from the classics to the CRISPR genome editing | A. Pujol | |
| 11– 12 | Introduction to mouse development: segmentation, gastrulation, the embryonic period, and the foetal period | J. Ruberte | |
| 12-13 | The placenta and Annexes | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Wednesday, September 9th | |||
| 9.00 – 11.00 | Skeleton of thoracic limb: scapula, clavicle, humerus, ulna, carpal, metacarpal, and digital bones. Identification of main anatomical features in isolated bones | L. Mendes-Jorge | |
| 11.00 – 13.00 | Skeleton of pelvic limb: coxal, femur, tibia, fibula, tarsal, and metatarsal bones. Identification of main anatomical features in isolated bones | L. Mendes-Jorge | |
|
|
|
||
| Thursday, September 10th | |||
| 9.00 – 11.00 | Bone Ontogeny. Bone histology, immunohistochemistry, and ultrastructure. Strain, gender, and age differences | J. Ruberte |
|
| 11.00 – 12.30 | Skull: neurocranium and splanchnocranium. Identification of main anatomical features in isolated bones | J. Ruberte | |
| 12.30-13.30 | Mandible. Identification of main anatomical features in isolated bones | S. Olvera-Maneu | |
|
|
|
||
| Monday, September 14th | |||
| 9.00 – 11.00 | Skeleton of the trunk: vertebral column, ribs and sternum. Identification of main anatomical features in isolated bones | A. Carretero | |
| 11.00 – 13.00 | Arthrology: shoulder, elbow, hip, and stifle joints. Myology: types of muscles, histology, histochemistry, immunohistochemistry and ultrastructure | M. Navarro | |
|
|
|
||
| Tuesday, September 15th | |||
| 9.00 – 10.00 | Main muscular groups | M. Navarro | |
| 10.00 – 11.00 | Peripheral nerves | J. Ruberte | |
| 11.00 – 12.00 | Common errors in tissue processing | P. Jaramillo | |
| 12.00 – 14.00 | Advanced optical microscopy | D. Ramos | |
|
|
|
||
| Wednesday, September 16th | |||
| 9.00 – 11.00 | Dissection of main muscular groups and peripheral nerves | M. Navarro and J. Ruberte | |
| 11.00 – 12.00 | Anatomical basis of cardiovascular development | J. Ruberte | |
| 12.00 – 13.00 | Heart: topography, structure, and vascularization | J. Ruberte | |
|
|
|||
| Thursday, September 17th | |||
| 9.00 – 11.00 | Localization, disposition, and topography of main vessel trunks. Structure of blood and lymphatic vessels. Components of the vascular wall | J. Ruberte | |
| 11.00 – 13.00 | Digital histology – Session I | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Friday, September 18th | |||
| 9.30-11.30 | Blood: cellular morphology and clinical analysis | E. José-Cunilleras | |
| 11.30 – 12.30 | Blood: clinical analysis | E. José-Cunilleras | |
|
|
|
||
| Monday, September 21st | |||
| 9.00 – 11.00 | Topography and histology of lymphatic nodes | J. Ruberte | |
| 11.00 – 13.00 | Demonstration of lymphatic nodes | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Tuesday, September 22nd | |||
| 9.00 – 10.00 | Anatomical basis of gastropulmonar development | J. Ruberte | |
| 10.00 – 11.30 | Respiratory apparatus: nasal cavities, larynx, trachea and lungs | M. Navarro | |
| 11.30 – 13.00 | Oral cavity, pharynx, oesophagus, and stomach | V. Nacher | |
|
|
|
||
| Wednesday, September 23rd | |||
| 9.30 – 11.30 | Dissection of the thorax | M. Navarro and J. Ruberte | |
| 11.30– 12.30 | Intestine and liver | L. d’Angelo | |
|
|
|
||
| Friday, September 25th | |||
| 9.30 – 10.30 | Anatomical basis of urogenital development | A. Carretero | |
| 10.30 – 11.30 | Male and female genital organs | A. Carretero | |
| 11.30 – 12.30 | Urinary organs | L. d’Angelo | |
|
|
|
||
| Monday, September 28th | |||
| 9.00 – 11.00 | Dissection of male and female abdominal and pelvic cavities | A. Carretero and M. Navarro | |
| 12.00 – 14.00 | Electron microscopy | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Tuesday, September 29th | |||
| 9.00 – 10.00 | Pancreas | V. Nacher | |
| 10.00 – 11.00 | Thyroid, parathyroid, and adrenal glands | V. Nacher | |
| 11.00 – 12.00 | Basic developmental concepts and general morphology of the central nervous system | J. Ruberte | |
| 12.00 – 13.00 | Spinal cord and rhombencephalon | J. Ruberte | |
| Wednesday, September 30th | |||
| 9.00 – 10.00 | Cerebellum and mesencephalon | J. Ruberte | |
| 10.00 – 11.00 | Diencephalon and hypothalamus | J. Ruberte | |
| 11.00 – 12.00 | Telencephalon | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Thursday, October 1st | |||
| 9.30 – 10.30 | Hypophysis and pineal gland | J. Ruberte | |
| 10.30 – 11.30 | Cranial nerves | J. Ruberte | |
| 11.30 – 12.30 | Encephalic ventricles and brain vascularization | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Friday, October 2nd | |||
| 9.00 – 10.00 | Vestibulocochlear organ | M. Navarro | |
| 10.00 – 11.00 | Eye and related structures | J. Ruberte | |
| 15.00 – 17.00 | Dissection of the central nervous system and eye | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Monday, October 5th | |||
| 9.00 – 11.00 | Retinal Vascularization | J. Ruberte | |
| 11.00 – 13.00 | Digital histology – Session II | J. Ruberte |
|
| Tuesday, October 6th | |||
| 9.00 – 11.00 | In vivo retinal angiography Eye morphological and physiological phenotyping. Dissection of the eye. | D. Ramos and M. Lopez-Luppo | |
| 12.00 – 13.00 | Neoplasms | J. Ruberte | |
|
|
|
||
| Wednesday, October 7th | |||
| 10.00 – 11.00 | Cellular damage. Apoptosis. Necrosis. Senescence | J. Ruberte | |
| 11.00 -12.00 | Cellular and tissue deposits | J. Ruberte | |
| Thursday, October 8th | |||
| 10.00- 11.00 | Local and systemic circulatory disorders | J. Ruberte | |
| 11.00 – 12.00 | Inflammation, reparation, and regeneration | J. Ruberte | |
|
|
|
Workshop on Mouse Pathobiology
| Tuesday, October 13th | ||
| 8:45 – 9:00 | Registration and Opening | |
| 9:00 – 10:00 | Standardized Genetic Nomenclature for Mice and Rats | F. Benavides |
| 10:00 – 11:00 | Mouse Model and Morphologic Phenotyping: A Comparative Pathologist Perspective | P. R. Ruivo |
| 11:00 – 11:30 | Coffee break | |
| 11:30 – 12:30 | Skin Morphology and Function in Health and Rare Disease: Insights from Human Disease Models | R. Sedlacek |
| 12:30 – 13:30 | TBD | Y. Herault |
| 13:30 – 14:30 | Lunch break | |
| 14:30 – 15:30 | Spontaneous Pathology in Short Term (Juvenile) Mouse Studies | D. Corbetta |
| 15:30 – 16:30 | Histological and Pathological Assessment of the Mouse Kidney | P. da Silva-Buttkus |
| 16:30 – 17:30 | Mouse Necropsy | J. Ruberte |
|
|
|
|
|
|
Wednesday, October 14th | |
| 9:00 – 10:00 | Histology of the Mouse Thymus and Spleen: Pathological Insights into the Lymphoid and Hematopoietic Systems | P. da Silva-Buttkus |
| 10:00 – 11:00 | Pathology of immunodeficient and humanized mice (I) | P. R. Ruivo |
| 11:00 – 11:30 | Coffee break | |
| 11:30 – 12:30 | Pathology of immunodeficient and humanized mice (II) | P. R. Ruivo |
| 12:30 – 13:30 | Histopathologic Analysis of Mouse Lymph Nodes | P. da Silva-Buttkus |
| 13:30 – 14:30 | Lunch break | |
| 14:30 – 15:30 | Spontaneous Pathology in Long Term (Aged) Mouse Studies (non-neoplastic lesions) | D. Corbetta |
| 15:30 – 16:30 | Pathological Evaluation of the Developing Placenta | O. Wendling |
| 16:30 – 17:30 | Retinal Vascular Heterogenicity: Implications in Hypertension | D. Ramos |
|
|
|
|
| Thursday, October 15th | ||
| 9:00 – 10:00 | Astrocytic Gene Therapy in Mouse Models of MLC: Reversion of brain edema and motor function | A. Bosch |
| 10:00 –11:00 | Mapping the Lymphatic Drainage in the Mouse | S. Olvera-Maneu |
| 11:00 – 11:30 | Coffee break | |
| 11:30 – 12:30 | Spontaneous Pathology in Long Term (Aged) Mouse Studies (neoplastic lesions) | D. Corbetta |
| 12:30 –13:30 | Mouse Models of Human Cancer | F. Benavides |
| 13: 30 – 14:30 | Lunch break | |
| Session on TERMINOLOGY, ONTOLOGY and DATABASES | ||
| 14:30 – 15:30 | Bridging Mouse and Human Anatomies: a knowledge and terminology-based approach for disease model phenotyping | J. Ruberte |
| 15:30 – 16.30 | Connecting Phenotypes Across Species Using LLM Embeddings | J. McLaughlin |
| 16:30 – 17:30 | What’s in a Name? From Confusion to Clarity in Anatomical Terms | W. Van den Broeck |
| 17.30 | PANEL DISCUSSION | |
|
|
|
|
List of speakers
| Speaker | Institution | ||
| Benavides, Fernando | |||
| Bosch, Assumpció | |||
| Corbetta, Davide | |||
| Da Silva-Buttkus, Patricia | |||
| Herault, Yann | |||
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|||
|
|
|||
| McLaughlin, James | |||
| Olvera-Maneu, Sergi | |||
| Ramos, David | |||
| Ruivo, Pedro Reis | |||
| Ruberte, Jesús | |||
| Sedlacek, Radek | |||
| Van den Broeck, Wim | |||
| Wendling, Olivia | |||
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|||
|
|
|
|
|
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Classes magistrals | 82 | 3,28 | CM01, CM02, KM01, KM02, KM03, KM05, KM06, SM01 |
| Pràctiques laboratori | 24,5 | 0,98 | KM03, KM06, SM01, SM02 |
| Estudi autònom | 138,5 | 5,54 | CM01, CM02 |
La metodologia utilitzada en el procés d'ensenyament i aprenentatge de l'assignatura es basa en què l'estudiant treballi la informació que se li posa al seu abast per diferents mitjans. La funció del professor és ajudar-lo en aquesta tasca, no només amb informació o indicant-li on pot obtenir-la, sinó també dirigint i supervisant que el procés d'aprenentatge es desenvolupi de manera eficaç. En sintonia amb aquestes idees, i d'acord amb els objectius de l'assignatura, el desenvolupament del curs es basa en les següents activitats:
- Classes magistrals: Mitjançant les classes magistrals l'estudiant adquireix els coneixements científics propis de la disciplina, que haurà de completar amb l'estudi personal i autònom dels temes explicats.
- Pràctiques laboratori: Les classes pràctiques apropen els models teòrics a la realitat i reforcen, completen i permeten aplicar els coneixements adquirits a les classes magistrals. A les pràctiques de laboratori, mitjançant el treball en grups reduïts, s'estudien les ossos, es fan disseccions i s’observen preparacions histològiques. A partir de l’observació d'aquests espècimens l'estudiant adquireix un concepte tridimensional de la disposició estructural, que permetrà comprendre, per exemple, el moviment de les articulacions, la biomecànica dels músculs, la distribució dels vasos i nervis, o la juxtaposició d'estructures adjacents. A les sessions pràctiques l'alumne desenvoluparà, a més, destresa manual i habilitats com la curiositat i la capacitat d'observació. Es controlarà l'assistència a les pràctiques.
El seguiment de l'aprenentatge de l'estudiant tindrà lloc mitjançant diferents proves d'avaluació que es desenvoluparan a les sales de dissecció i microscòpia. Aquestes proves permetran seguir l'aprofitament dels continguts de les sessions pràctiques i també la integració amb els continguts adquirits a les classes magistrals.
El material docent utilitzat a la assignatura estarà disponible a la plataforma Moodle.
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Examen oral pràctic | 40 | 1 | 0,04 | CM01, CM02, KM03, KM04, KM06, SM01, SM02 |
| Examen escrit tipus test | 50 | 2 | 0,08 | KM01, KM02, KM03, KM05, KM06, SM01 |
| Controls individuals continuos del treball práctic | 10 | 2 | 0,08 | CM01, CM02 |
L’avaluació es durà a terme de manera contínua al llarg del mòdul mitjançant preguntes als estudiants durant les classes teòriques i les sessions pràctiques, les quals representaran un 10% de la nota final del mòdul.
Al final del mòdul s’establiran dos controls finals. El primer serà un examen pràctic oral sobre espècimens reals (ossos, disseccions i làmines histològiques digitals) utilitzats durant la docència. Les qualificacions obtingudes en aquest examen oral representaran un 40% de la nota final.
Per poder accedir a l’examen teòric, serà necessari obtenir una nota mínima de 4,5 punts sobre 10 en l’examen pràctic. L’examen teòric consistirà en una prova de preguntes de resposta múltiple i representarà un 50% de la nota final.
La nota mínima per aprovar el mòdul és de 5.
Bibliografia
- Cook MJ (1965). The Anatomy of the Laboratory Mouse. Academic Press. Freely available at: www.informatics.jax.org/cookbook
- Smith RS, John SWM, Nishina PM, Sundberg JP (2000). Systematic Evaluation of the Mouse Eye. Anatomy, Pathology, and Biomethods. CRC Press
- Iwaki T, Yamashita H, Hayakawa T (2001). A color Atlas of Sectional Anatomy of the Mouse. Braintree Scientific Inc
- Popesko P, Rajtová V, Horák J (2002). Colour Atlas of Anatomy of Small Laboratory Animals. Volume two: Rat, Mouse, and Hamster. Saunders Company
- Paxinos G and Franklin KBJ (2008). The Mouse Brain in Stereotaxic Coordinates. Compact Third Edition. Academic Press
- Constantinescu GM (2011). Comparative Anatomy of the Mouse and the Rat. CRC Press
- Watson C, Paxinos G, Puelles L (2011). The Mouse Nervous System. Academic Press
- Scudamore CL (2014) A Practical Guide to the Histology of the Mouse. Willey Blackwell
- Ruberte J, Carretero A, Navarro M (2017). Morphological Mouse Phenotyping. Anatomy, Histology and Imaging. Academic Press
- Treuting PM, Dintzis SM, Montine KS (2018). Comparative Anatomy and Histology. A Mouse, Rat, and Human Atlas. Academic Press
- Sundberg JP, Vogel P, Ward JM (2022) Pathology of Genetically Engineered and other Mutant Mice. Wiley Blackwell
Programari
No aplica
Grups i idiomes de l'assignatura
La informació proporcionada és provisional fins al 30 de novembre. A partir d'aquesta data, podreu consultar l'idioma de cada grup a través d'aquest enllaç. Per accedir a la informació, caldrà introduir el CODI de l'assignatura
| Tipus de docència | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (TEm) Teoria (màster) | 1 | Anglès | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PLABm) Pràctiques de laboratori (màster) | 1 | Anglès | primer quadrimestre | matí-mixt |