Biología de Sistemas de las Plantas
Código: 44787Créditos: 6
| Titulación | Tipo | Curso |
|---|---|---|
| Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales / Plant Biology, Genomics and Biotechnology | OP | 1 |
Profesor/a de contacto
- Nombre :
- Ana Martin Hernandez
- Correo electrónico :
- anamontserrat.martin@uab.cat
Equipo docente
- Juan Jose Lopez-Moya Gomez
- Elena Monte Collado
Equipo docente (externo a la UAB)
- Antoni Gacia-Molina
- Jae-Seong Yang
- Nicolas Bologna
- Iban Eduardo
Idiomas de los grupos
Puede consultar esta información al final del documento.
Prerrequisitos
Conocimientos básicos de Genética y Biología Molecular
Objetivos
Proporcionar al alumnado una visión global y actual de las técnicas, fundamentos y aplicaciones de la
Genómica Vegetal e introducirlos/as en la Biología de Sistemas de las plantas. Los objetivos específicos incluyen
la comprensión de los siguientes aspectos: la diversidad y complejidad de los genomas vegetales, las técnicas
empleadas habitualmente en los estudios de genómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica y las
aplicaciones a la mejora genética de las plantas cultivadas, así como el uso de modelado predictivo a través de la
integración de los datos de las diferentes -ómicas.
Resultados de aprendizaje
- (CA12) Utilizar nuevas herramientas bioinformáticas para describir modelos predictivos de datos experimentales ómicos en el ámbito de la Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales.
- (CA17) Aplicar la terminología científica para argumentar los resultados de la investigación en mejora genética de plantas de cultivo y comunicarlos oralmente y por escrito en un entorno internacional.
- (KA15) Describir los resultados de los análisis de datos derivados de estudios proteómicos, y metabolómicos aplicados a la mejora de plantas de cultivo.
- (KA16) Seleccionar metodologías de estudio en genómica vegetal y estudio de casos prácticos a través de múltiples "omics".
- (SA28) Comunicar los resultados de la investigación en el ámbito de la Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales en inglés oralmente y por escrito utilizando una terminología científica adecuada.
- (SA29) Aplicar los conocimientos de genética molecular y la mejora de las plantas de cultivo en diferentes ámbitos científicos e industriales.
- (SA30) Aplicar los métodos y técnicas empleadas habitualmente en los estudios de genómica, fenómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica.
- (SA31) Aplicar herramientas bioinformáticas al estudio genético, evolutivo y funcional de los vegetales e interpretar los resultados obtenidos de los experimentos realizados.
Contenidos
Biología de Sistemas: conceptos, metodología y estudios de casos utilizando múltiples -ómicas. El caso de
estudio será la aparición de una nueva enfermedad que afecta y mata todas las variedades de tomate. Los
estudiantes realizarán un viaje a través de todas las -ómicas para descubrir la causa y buscar una solución
científica viable para su aplicación en la mejora de plantas cultivadas.
Específicamente,
Se utilizarán aplicaciones prácticas de métodos y técnicas en fenómica y genómica vegetales, incluyendo el
uso de marcadores moleculares en la mejora vegetal. Importancia de los QTLs en este problema.
Análisis y aplicación de datos derivados de experimentos de genómica y de transcriptómica para limitar el
problema.
Análisis y aplicación de datos derivados de los experimentos de proteómica, interactómica y metabolómica
para encontrar una solución al problema.
Análisis integrado del caso de estudio aplicados, incluyendo la modelización computacional, para la mejora de
plantas de cultivo.
Actividades formativas y Metodología
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| Tipo: Autónoma | |||
| Estudio Personal | 84 | 3,36 | |
| Tipo: Dirigida | |||
| Conferencias y charlas de expertos | 12 | 0,48 | |
| Problemas y casos prácticos | 18 | 0,72 | |
| Tipo: Supervisada | |||
| Preparación de informes | 35 | 1,4 |
Conferencias y charlas de expertos
Problemas y casos prácticos
Preparación de informes
Estudio personal
Evaluación
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Conferencias y charlas de expertos | 10% | 0 | 0 | CA12, CA17, KA15, KA16, SA29, SA30, SA31 |
| Cuestionario final | 30% | 1 | 0,04 | CA12, CA17, KA16, SA29, SA30 |
| Informe | 60% | 0 | 0 | CA12, CA17, KA15, KA16, SA28, SA29, SA30, SA31 |
Evaluación continua 10%
Informe 60%
Cuestionario final 30%
Esta asignatura/módulo no contempla el sistema de evaluación única.
Para esta asignatura, se permite el uso de tecnologías de Inteligencia Artificial (IA) exclusivamente en tareas de soporte, como la búsqueda bibliográfica o de información, la corrección de textos o las traducciones. El estudiante deberá identificar claramente qué partes han sido generadas utilizando esta tecnología, especificar las herramientas utilizadas e incluir una reflexión crítica sobre cómo éstas han influido en el proceso y el resultado final de la actividad. La no transparencia del uso de la IA en esta actividad evaluable se considerará falta de honestidad académica y puede acarrear una penalización parcial o total en la nota de la actividad o sanciones mayores en casos de gravedad.
Bibliografía
Yunbi Xu Molecular Plant Breeding. CAB International Oxfordshire, UK disponible online a Biblioteca UAB
:http://www.cabi.org/cabebooks/FullTextPDF/2010/20103101750.pdf
Artículos y revisiones específicas recomendados en clase.
Software
MapQTL 6.0
JoinMap 5.0
R
RStudio
Grupos e idiomas de la asignatura
La información proporcionada es provisional hasta el 30 de noviembre. A partir de esta fecha, podrá consultar el idioma de cada grupo a través de este enlace. Para acceder a la información, será necesario introducir el CÓDIGO de la asignatura
| Tipo de docencia | Grupo | Idioma | Semestre | Turno |
|---|---|---|---|---|
| (TEm) Teoría (máster) | 1 | Inglés | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |
| (PAULm) Prácticas de aula (máster) | 1 | Inglés | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |