Biologia de Sistemes de les Plantes
Codi: 44787Crèdits: 6
| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology | OP | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom :
- Ana Martin Hernandez
- Correu electrònic :
- anamontserrat.martin@uab.cat
Equip docent
- Juan Jose Lopez-Moya Gomez
- Elena Monte Collado
Equip docent (extern a la UAB)
- Antoni Gacia-Molina
- Jae-Seong Yang
- Nicolas Bologna
- Iban Eduardo
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Coneixements basics de Genètica i Biologia Molecular
Objectius
Proporcionar a l'alumnat una visió global i actual de les tècniques, fonaments i aplicacions de la Genòmica
Vegetal i introduir-les en la Biologia de Sistemes de les plantes. Els objectius específics inclouen la
comprensió dels següents aspectes: la diversitat i complexitat dels genomes vegetals, les tècniques emprades
habitualment en els estudis de genòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica i les aplicacions a la
millora genètica de les plantes de conreu. Inclouen també l'us de modelat predictiu mitjanant d'integració de diferents dades -omiques
Resultats d'aprenentatge
- (CA12) Utilitzar noves eines bioinformàtiques per a descriure models predictius de dades experimentals òmiques en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals.
- (CA17) Aplicar la terminologia científica per a argumentar els resultats de la investigació en la millora genètica de plantes de cultiu i comunicar-los oralment i per escrit en un entorn internacional.
- (KA15) Descriure els resultats de les anàlisis de dades derivades d'estudis proteòmics i metabolòmics aplicats a la millora de plantes de cultiu.
- (KA16) Seleccionar metodologies d'estudi en genòmica vegetal i estudi de casos pràctics a través de múltiples òmiques.
- (SA28) Comunicar els resultats de la investigació en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals en anglès, oralment i per escrit, utilitzant una terminologia científica adequada.
- (SA29) Aplicar els coneixements de genètica molecular i la millora de les plantes de cultiu en diferents àmbits científics i industrials.
- (SA30) Aplicar els mètodes i les tècniques usats habitualment en els estudis de genòmica, fenòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica.
- (SA31) Aplicar eines bioinformàtiques a l'estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals i interpretar els resultats obtinguts dels experiments duts a terme.
Continguts
Biologia de sistemes: conceptes, metodologia i estudis de casos utilitzant múltiples omiques. El cas d'estudi
serà l'aparició d'una nova malaltia que afecta i mata totes les varietats de tomàquet. Els estudiants realitzaran
un viatge a través de totes les -omiques per descobrir la causa i buscar una solució científica viable per a la
seva aplicació en la millora de plantes de cultiu.
Concretament:
Utilitzarem aplicacions pràctiques de mètodes i tècniques en fenòmica i genòmica vegetals, incloent l'ús de
marcadors moleculars en la millora vegetal. Importància dels QTLs en aquest problema.
Anàlisi i aplicació de dades derivades dels estudis de genòmica i de transcriptòmica per limitar el problema.
Anàlisi i aplicació de dades derivades dels estudis de proteòmica, interactòmica i metabolòmica per trobar una
solució al problema.
Anàlisi integrativa del cas de l'estudi aplicats, inclosa la modelització computacional, per a la millora de plantes
de conreu.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Autònoma | |||
| Estudi personal | 84 | 3,36 | |
| Tipus: Dirigida | |||
| Conferencies i xerrades d'experts | 12 | 0,48 | |
| Problemes i casos pràctics | 18 | 0,72 | |
| Tipus: Supervisada | |||
| Preparació d'informes | 35 | 1,4 |
Conferències i xerrades d'experts
Problemes i casos pràctics
Preparació d'informes
Estudi personal
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Conferencies i xerrades d'experts | 10% | 0 | 0 | CA12, CA17, KA15, KA16, SA29, SA30, SA31 |
| Informe | 60% | 0 | 0 | CA12, CA17, KA15, KA16, SA28, SA29, SA30, SA31 |
| Qüestionari final | 30% | 1 | 0,04 | CA12, CA17, KA16, SA29, SA30 |
Avaluació continua 10%
Informe 60%
Qüestionari final 30%
Aquesta assignatura/mòdul no preveu el sistema d’avaluació única.
Per a aquesta assignatura, es permet l'ús de tecnologies d'Intel·ligència Artificial (IA) exclusivament en [tasques de suport, com la cerca bibliogràfica o d’informació, la correcció de textos o les traduccions. L'estudiant haurà d'identificar clarament quines parts han estat generades utilitzant aquesta tecnologia, especificar les eines emprades i incloure una reflexió crítica sobre com aquestes han influït en el procés i el resultat final de l’activitat. La no transparència de l’ús de la IA en aquesta activitat avaluable es considerarà falta d'honestedat acadèmica i pot comportar una penalització parcial o total en la nota de l'activitat, o sancions majors en casos de gravetat.
Bibliografia
Yunbi Xu Molecular Plant Breeding. CAB International Oxfordshire, UK disponible online a Biblioteca UAB
:http://www.cabi.org/cabebooks/FullTextPDF/2010/20103101750.pdf
Articles i revisions específiques recomanats a classe
Programari
MapQTL 6.0
JoinMap 5.0
R
RStudio
Grups i idiomes de l'assignatura
La informació proporcionada és provisional fins al 30 de novembre. A partir d'aquesta data, podreu consultar l'idioma de cada grup a través d'aquest enllaç. Per accedir a la informació, caldrà introduir el CODI de l'assignatura
| Tipus de docència | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (TEm) Teoria (màster) | 1 | Anglès | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (PAULm) Pràctiques d'aula (màster) | 1 | Anglès | segon quadrimestre | matí-mixt |