Avís important
La guia docent és provisional.
La versió en PDF de la guia docent pot tardar uns dies en estar disponible al DDD.
Biologia de Sistemes de les Plantes
Codi: 44787Crèdits: 6
| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology | OP | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom :
- Ana Martin Hernandez
- Correu electrònic :
- anamontserrat.martin@uab.cat
Equip docent
- Juan Jose Lopez-Moya Gomez
- Elena Monte Collado
Equip docent (extern a la UAB)
- Antoni Gacia-Molina
- Iban Eduardo
- Jae-Seong Yang
- Nicolas Bologna
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Coneixements basics de Genètica i Biologia Molecular
Objectius
Proporcionar a l'alumnat una visió global i actual de les tècniques, fonaments i aplicacions de la Genòmica
Vegetal i introduir-les en la Biologia de Sistemes de les plantes. Els objectius específics inclouen la
comprensió dels següents aspectes: la diversitat i complexitat dels genomes vegetals, les tècniques emprades
habitualment en els estudis de genòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica i les aplicacions a la
millora genètica de les plantes de conreu. Inclouen també l'us de modelat predictiu mitjanant d'integració de diferents dades -omiques
Resultats d'aprenentatge
- CA12 (Utilitzar noves eines bioinformàtiques per a descriure models predictius de dades experimentals òmiques en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals.) Utilitzar noves eines bioinformàtiques per a descriure models predictius de dades experimentals òmiques en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals.
- CA17 (Aplicar la terminologia científica per a argumentar els resultats de la investigació en la millora genètica de plantes de cultiu i comunicar-los oralment i per escrit en un entorn internacional.) Aplicar la terminologia científica per a argumentar els resultats de la investigació en la millora genètica de plantes de cultiu i comunicar-los oralment i per escrit en un entorn internacional.
- KA15 (Descriure els resultats de les anàlisis de dades derivades d'estudis proteòmics i metabolòmics aplicats a la millora de plantes de cultiu.) Descriure els resultats de les anàlisis de dades derivades d'estudis proteòmics i metabolòmics aplicats a la millora de plantes de cultiu.
- KA16 (Seleccionar metodologies d'estudi en genòmica vegetal i estudi de casos pràctics a través de múltiples òmiques.) Seleccionar metodologies d'estudi en genòmica vegetal i estudi de casos pràctics a través de múltiples òmiques.
- SA28 (Comunicar els resultats de la investigació en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals en anglès, oralment i per escrit, utilitzant una terminologia científica adequada.) Comunicar els resultats de la investigació en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals en anglès, oralment i per escrit, utilitzant una terminologia científica adequada.
- SA29 (Aplicar els coneixements de genètica molecular i la millora de les plantes de cultiu en diferents àmbits científics i industrials.) Aplicar els coneixements de genètica molecular i la millora de les plantes de cultiu en diferents àmbits científics i industrials.
- SA30 (Aplicar els mètodes i les tècniques usats habitualment en els estudis de genòmica, fenòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica.) Aplicar els mètodes i les tècniques usats habitualment en els estudis de genòmica, fenòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica.
- SA31 (Aplicar eines bioinformàtiques a l'estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals i interpretar els resultats obtinguts dels experiments duts a terme.) Aplicar eines bioinformàtiques a l'estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals i interpretar els resultats obtinguts dels experiments duts a terme.
Continguts
Biologia de sistemes: conceptes, metodologia i estudis de casos utilitzant múltiples omiques. El cas d'estudi
serà l'aparició d'una nova malaltia que afecta i mata totes les varietats de tomàquet. Els estudiants realitzaran
un viatge a través de totes les -omiques per descobrir la causa i buscar una solució científica viable per a la
seva aplicació en la millora de plantes de cultiu.
Concretament:
Utilitzarem aplicacions pràctiques de mètodes i tècniques en fenòmica i genòmica vegetals, incloent l'ús de
marcadors moleculars en la millora vegetal. Importància dels QTLs en aquest problema.
Anàlisi i aplicació de dades derivades dels estudis de genòmica i de transcriptòmica per limitar el problema.
Anàlisi i aplicació de dades derivades dels estudis de proteòmica, interactòmica i metabolòmica per trobar una
solució al problema.
Anàlisi integrativa del cas de l'estudi aplicats, inclosa la modelització computacional, per a la millora de plantes
de conreu.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Conferencies i xerrades d'experts | 12 | 0,48 | |
| Estudi personal | 84 | 3,36 | |
| Preparació d'informes | 35 | 1,4 | |
| Problemes i casos pràctics | 18 | 0,72 |
Conferències i xerrades d'experts
Problemes i casos pràctics
Preparació d'informes
Estudi personal
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Qüestionari final | 30% | 1 | 0,04 | CA12, CA17, KA16, SA29, SA30 |
| Conferencies i xerrades d'experts | 10% | 0 | 0 | CA12, CA17, KA15, KA16, SA29, SA30, SA31 |
| Informe | 60% | 0 | 0 | CA12, CA17, KA15, KA16, SA28, SA29, SA30, SA31 |
Avaluació continua 10%
Informe 60%
Qüestionari final 30%
Aquesta assignatura/mòdul no preveu el sistema d’avaluació única.
Per a aquesta assignatura, es permet l'ús de tecnologies d'Intel·ligència Artificial (IA) exclusivament en [tasques de suport, com la cerca bibliogràfica o d’informació, la correcció de textos o les traduccions. L'estudiant haurà d'identificar clarament quines parts han estat generades utilitzant aquesta tecnologia, especificar les eines emprades i incloure una reflexió crítica sobre com aquestes han influït en el procés i el resultat final de l’activitat. La no transparència de l’ús de la IA en aquesta activitat avaluable es considerarà falta d'honestedat acadèmica i pot comportar una penalització parcial o total en la nota de l'activitat, o sancions majors en casos de gravetat.
Bibliografia
Yunbi Xu Molecular Plant Breeding. CAB International Oxfordshire, UK disponible online a Biblioteca UAB
:http://www.cabi.org/cabebooks/FullTextPDF/2010/20103101750.pdf
Articles i revisions específiques recomanats a classe
Programari
MapQTL 6.0
JoinMap 5.0
R
RStudio
Grups i idiomes de l'assignatura
La informació proporcionada és provisional fins al 30 de novembre. A partir d'aquesta data, podreu consultar l'idioma de cada grup a través d'aquest enllaç. Per accedir a la informació, caldrà introduir el CODI de l'assignatura
| Tipus de docència | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (TEm) Teoria (màster) | 1 | Anglès | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (PAULm) Pràctiques d'aula (màster) | 1 | Anglès | segon quadrimestre | matí-mixt |