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Biología Molecular de las Plantas
Código: 44781Créditos: 6
| Titulación | Tipo | Curso |
|---|---|---|
| Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales / Plant Biology, Genomics and Biotechnology | OP | 1 |
Profesor/a de contacto
- Nombre :
- David Caparrós Ruiz
- Correo electrónico :
- david.caparros@uab.cat
Equipo docente
- Laia Armengot Martinez
- Narciso Campos Martinez
- Jordi Moreno Romero
Idiomas de los grupos
Puede consultar esta información al final del documento.
Prerrequisitos
Aunque no hay requisitos previos oficiales para estudiar este módulo, se recomienda haber adquirido previamente conocimientos básicoss en
Bioquímica, Biología Molecular y Genética, preferentemente en el area de plantas.
Objetivos
El objetivo general de este módulo es capacitar a especialistas con habilidades sólidas y actualizadas en biología y biotecnología Los objetivos específicos del módulo son:
- Comprender y poder identificar las principales características de las plantas que se aplican en los estudios de genética molecular.
- Comprender las principales características de la estructura y expresión del gen vegetal.
- Describir las técnicas de manipulación y producción de plantas modificadas genéticamente.
- Comprender el proceso de transformación genética de las plantas y los conceptos relacionados de cisgénesis y transgénesis.
- Comprender y ser capaz de utilizar herramientas para el estudio del genoma, proteoma, transcriptoma y metaboloma.
- Integrar los conocimientos adquiridos para resolver temas prácticos en el contexto de un laboratorio de Biología Molecular.
Resultados de aprendizaje
- CA03 (Reconocer las consideraciones éticas, de responsabilidad social y legales al uso de las plantas modificadas genéticamente valorando el impacto social, económico y medioambiental para aplicarlas al entorno científico y profesional, de acuerdo con los Objetivos del Desarrollo Sostenible.) Reconocer las consideraciones éticas, de responsabilidad social y legales al uso de las plantas modificadas genéticamente valorando el impacto social, económico y medioambiental para aplicarlas al entorno científico y profesional, de acuerdo con los Objetivos del Desarrollo Sostenible.
- CA04 (Integrar conocimientos de biología molecular y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.) Integrar conocimientos de biología molecular y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
- KA03 (Reconocer los procesos más adecuados en la obtención de plantas modificadas genéticamente y su uso.) Reconocer los procesos más adecuados en la obtención de plantas modificadas genéticamente y su uso.
- KA04 (Identificar los resultados de investigación en ingeniería genética vegetal en la obtención de nuevos productos o procesos viables, a nivel industrial y comercial, para su transferencia a la sociedad.) Identificar los resultados de investigación en ingeniería genética vegetal en la obtención de nuevos productos o procesos viables, a nivel industrial y comercial, para su transferencia a la sociedad.
- SA05 (Gestionar información bibliográfica y recursos informáticos en el ámbito de la estructura, expresión y regulación génica.) Gestionar información bibliográfica y recursos informáticos en el ámbito de la estructura, expresión y regulación génica.
- SA06 (Debatir críticamente problemas derivados de las investigaciones en biología molecular de las plantas.) Debatir críticamente problemas derivados de las investigaciones en biología molecular de las plantas.
- SA07 (Aplicar los conocimientos de genética molecular de las plantas en diferentes ámbitos científicos e industriales.) Aplicar los conocimientos de genética molecular de las plantas en diferentes ámbitos científicos e industriales.
- SA08 (Aplicar herramientas bioinformáticas al estudio genético, evolutivo y funcional de los vegetales y al tratamiento de datos "omicos" de las plantas.) Aplicar herramientas bioinformáticas al estudio genético, evolutivo y funcional de los vegetales y al tratamiento de datos "omicos" de las plantas.
Contenidos
La asignatura se divide en dos partes. La primera (transformación genética de plantas), está constituida por
conceptos más teóricos relacionados con herramientas funcionales, y se da justo antes del tema de Genómica
de plantas. El resto del curso se da después de Genómica de plantas.
El concepto general del primer bloque de la asignatura corresponde a las herramientas funcionales de
El concepto general del primer bloque de la asignatura corresponde a las herramientas funcionales de
transformación genética de plantas:
-Transformación nuclear: la biología de agrobacterium, agrobacterium como vector de transformación,
transformación de bombardeo, transformación estable a transitoria, selección de plantas transformantes y
regulación de la expresión transgénica (promotores constitutivos, específicos e inducibles)
-Transformación de plastidios: integración de ADN exógeno en el genoma de los plastidios, vectores y diseño
genético (marcadores genéticos), transformación nuclear a plastidios, aplicaciones.
La segunda parte del curso consta de las siguientes partes:
-Se realiza una primera sesión de conocimientos generales, todos ellos relacionados con técnicas o
herramientas moleculares.
-Se realiza una sesión de bioinformática en el aula de informática de la facultad. Esta sesión tiene como
objetivo presentar a los estudiantes programas informáticos relacionados con la biología molecular. No
tratamos con conceptos de -ómica.
-Hay un ejercicio de prácticas en el aula. Se basa en trabajar con mutantes y OGM. Cómo hacerlos, cuáles
son apropiados y cuáles no. Se darán varios fenotipos y es necesario discutir qué alteraciones son lógicas y
cuáles no. Este ejercicio es un buen complemento de lo que se da en la primera parte del curso.
-Familiaridad con técnicas de biología molecular relacionadas con ChIP-Seq, ChIP-QPC, RNA-Seq y QPCR.
Los estudiantes trabajan en grupos y tienen que elaborar un experimento.
Actividades formativas y Metodología
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| seminarios | 16 | 0,64 | |
| estudios autónomos | 90 | 3,6 | |
| clases magistrales | 33 | 1,32 |
Las actividades de formación incluyen los siguientes elementos:
- Conferencias. Se realizarán clases presenciales de aula que desarrollan los contenidos teóricos.
- Resolución de casos prácticos. Se analizarán detenidamente casos de estudio procedentes de artículos de investigación recientes.
- Sesiones de bioinformática en las que se presentarán casos prácticos para formarse en las principales herramientas de bioinformática aplicadas
- Preparación y presentación de seminarios por parte de cada estudiante en relación con los contenidos del módulo.
- Las actividades autónomas incluyen la comprensión autónoma y el estudio de los contenidos del módulo, la investigación bibliográfica y la preparación
Evaluación
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Trabajo escrito relacionado con las clases | 35 | 2 | 0,08 | CA03, CA04, KA03, KA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
| presentación seminario | 25 | 2 | 0,08 | CA03, CA04, KA03, KA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
| preparación de seminarios | 20 | 4 | 0,16 | CA03, CA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
| actitud proactiva, participación en clase, rigor científico en las discusiones, etc. | 20 | 3 | 0,12 | CA03, CA04, KA03, KA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
La evaluación de este módulo se basará tanto en una evaluación continuada, con el fin de alentar los esfuerzos del estudiante a las actividades desarrolladas durante el curso, como en la entrega de trabajos relacionados con los conceptos tratados en clase. La asignatura se aprobará a partir de un cinco sobre 10.
En esta asignatura se permite el uso de tecnologías de Inteligencia Artificial (IA) como parte integrante del desarrollo del trabajo, siempre que el resultado final refleje una contribución significativa del estudiante en el análisis y la reflexión personal de la actividad. La no transparencia del uso de la IA se considerará falta de honestidad académica y puede comportar una penalización en la nota de la actividad, o sanciones mayores en casos de gravedad.
La realización de cualquier irregularidad en un acto de evaluación (fraude académico, plagio o uso indebido de la IA, salvo que este uso esté autorizado expresamente a la guía docente), que pueda conducir a una variación significativa de la calificación, supone que este acto se calificará con un 0. En caso de que la guía docente prevea que para superar la asignatura sea requisito imprescindible haber obtenido una nota mínima en este acto de evaluación o que se produzcan varias irregularidades en los actos de evaluación de una misma asignatura, la calificación final de esta asignatura es 0. Al margen de esto, se podrá instruir un proceso disciplinario al estudiante que incurra en alguna de estas irregularidades.
Bibliografía
Toda la bibliografía recomendada está disponible en la biblioteca de la UAB.
- Biotechnology and plant disease management. Editor(s): Z.K. Punja, S.H. De Boer and H. Sanfaçon.
Wallingford: CABI, 2007, ISBN: 9781845932886.
- Handbook of Plant Biotechnology Online. Editors-in-chef Paul Christou, Harry Klee. John Wiley and Sons,
2005. Online ISBN: 9780470869147; DOI: 10.1002/0470869143.
- Plant Biochemistry (Fourth Edition). Editor(s): Hans-Walter Heldt and Birgit Piechulla. London Academic,
2010. ISBN 9780123849861.
- Plant Biotechnology: Current and Future Applications of Genetically Modified Crops. Editor(s): Nigel G.
Halford. John Wiley & Sons, 2006, Print ISBN: 9780470021811, Online ISBN: 9780470021835, DOI:
10.1002/0470021837.
- Plant biotechnology and genetics: principles, techniques, and applications. Editors: C. Neal Stewart. Wiley,
2008. ISBN 9780470043813.
- Plant Biotechnology and Molecular Markers. Editors: P.S. Srivastava, Alka Narula, Sheela Srivastava. Kluwer
Academic Publishers, 2004. ISBN: 978-1-4020-1911-1 (Print) 978-1-4020-3213-4 (Online).
Journals in the area of Molecular Biology and Biotechnology of Plants (the 10 journals with highest impact
factor in the area of \"Plant Sciences\" of the Journal Citation Reports):
- ANNUAL REVIEW OF PLANT BIOLOGY, Publisher: ANNUAL REVIEWS. ISSN:1543-5008.
- TRENDS IN PLANT SCIENCE. Publisher: ELSEVIER SCIENCE LONDON. ISSN: 1360-1385
- ANNUAL REVIEW OF PHYTOPATHOLOGY. Publisher: ANNUAL REVIEWS. ISSN: 0066-4286
- PLANT CELL. Publisher: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS. ISSN: 1040-4651
- CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY. Publisher: CURRENT BIOLOGY LTD. ISSN: 1369-5266
- NEW PHYTOLOGIST. Publisher: WILEY-BLACKWELL. ISSN: 0028-646X
- PLANT JOURNAL. Publisher: WILEY-BLACKWELL. ISSN: 0960-7412
- PLANT PHYSIOLOGY. Publisher: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS. ISSN: 0032-0889
- PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL. Publisher: WILEY-BLACKWELL. ISSN: 1467-7644
- MOLECULAR PLANT. Publisher: OXFORD UNIV PRESS. ISSN: 1674-2052
El estudiante encontrará toda la información teórica requerida a través de las herramientas en línea que están disponibles en la Universidad.
Software
Los sitios web requeridos se proporcionarán durante los cursos.
Grupos e idiomas de la asignatura
La información proporcionada es provisional hasta el 30 de noviembre. A partir de esta fecha, podrá consultar el idioma de cada grupo a través de este enlace. Para acceder a la información, será necesario introducir el CÓDIGO de la asignatura
| Tipo de docencia | Grupo | Idioma | Semestre | Turno |
|---|---|---|---|---|
| (TEm) Teoría (máster) | 1 | Inglés | primer cuatrimestre | manaña-mixto |
| (PAULm) Prácticas de aula (máster) | 1 | Inglés | primer cuatrimestre | manaña-mixto |
| (SEMm) Seminarios (màster) | 1 | Inglés | primer cuatrimestre | manaña-mixto |