Avís important
La guia docent és provisional.
La versió en PDF de la guia docent pot tardar uns dies en estar disponible al DDD.

Biologia Molecular de les Plantes
Codi: 44781Crèdits: 6
| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology | OP | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom :
- David Caparrós Ruiz
- Correu electrònic :
- david.caparros@uab.cat
Equip docent
- Laia Armengot Martinez
- Narciso Campos Martinez
- Jordi Moreno Romero
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Tot i que no hi ha prerequisits oficials per a estudiar aquest mòdul, es recomana tenir coneixements bàsics en
Bioquímica, Biologia Molecular i Genètica, preferentment en l'àrea de plantes.
Objectius
L'objectiu general d'aquest mòdul és formar especialistes amb habilitats sòlides i actualitzades en biologia i biotecnologia vegetal, Els objectius específics del mòdul són:
- Comprendre i saber identificar les principals característiques de les plantes que s'apliquen als estudis de genètica molecular.
- Comprendre les característiques principals de l'expressió i l'estructura dels gens.
- Descriure les tècniques de manipulació i producció de plantes modificades genèticament.
- Comprendre el procés de transformació genètica de les plantes i els conceptes relacionats de cisgènesi i transgènesi.
- Comprendre i ser capaç d'utilitzar eines d'estudi del genoma, proteoma, transcriptoma i metaboloma.
- Integrar els coneixements adquirits per resoldre assignatures pràctiques sobre el context d'un laboratori de Biologia
Resultats d'aprenentatge
- CA03 (Reconèixer les consideracions ètiques, de responsabilitat social i legals en l'ús de les plantes modificades genèticament valorant l'impacte social, econòmic i mediambiental per a aplicar-les a l'entorn científic i professional, d'acord amb els objectius de desenvolupament sostenible.) Reconèixer les consideracions ètiques, de responsabilitat social i legals en l'ús de les plantes modificades genèticament valorant l'impacte social, econòmic i mediambiental per a aplicar-les a l'entorn científic i professional, d'acord amb els objectius de desenvolupament sostenible.
- CA04 (Integrar coneixements de biologia molecular i enfrontar-se a la complexitat de formular judicis a partir d'una informació que, tot i ser incompleta o limitada, inclogui reflexions sobre les responsabilitats socials i ètiques vinculades a l'aplicació dels seus coneixements i judicis.) Integrar coneixements de biologia molecular i enfrontar-se a la complexitat de formular judicis a partir d'una informació que, tot i ser incompleta o limitada, inclogui reflexions sobre les responsabilitats socials i ètiques vinculades a l'aplicació dels seus coneixements i judicis.
- KA03 (Reconèixer els processos més adequats en l'obtenció de plantes modificades genèticament i el seu ús.) Reconèixer els processos més adequats en l'obtenció de plantes modificades genèticament i el seu ús.
- KA04 (Identificar els resultats d'investigació en Enginyeria Genètica Vegetal en l'obtenció de nous productes o processos viables, a escala industrial i comercial, per a transferir-los a la societat.) Identificar els resultats d'investigació en Enginyeria Genètica Vegetal en l'obtenció de nous productes o processos viables, a escala industrial i comercial, per a transferir-los a la societat.
- SA05 (Gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics en l'àmbit de l'estructura, l'expressió i la regulació gènica.) Gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics en l'àmbit de l'estructura, l'expressió i la regulació gènica.
- SA06 (Debatre críticament problemes derivats de les investigacions en biologia molecular de les plantes.) Debatre críticament problemes derivats de les investigacions en biologia molecular de les plantes.
- SA07 (Aplicar els coneixements de genètica molecular de les plantes en diferents àmbits científics i industrials.) Aplicar els coneixements de genètica molecular de les plantes en diferents àmbits científics i industrials.
- SA08 (Aplicar eines bioinformàtiques a l'estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals i al tractament de dades òmiques de les plantes.) Aplicar eines bioinformàtiques a l'estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals i al tractament de dades òmiques de les plantes.
Continguts
L'assignatura es divideix en dues parts. Una primera (transformació genètica de les plantes), de conceptes
més teòrics relacionats amb eines funcionals, es realitza just abans de l'assignatura de Genòmica de les
plantes. La resta de l'assignatura es fa després de Genòmica de les plantes.
El primer bloc de l'assignatura té com a concepte general explicar-los les eines funcionals de la transformació
genètica de les plantes :
-Transformació nuclear: la biologia d'agrobacterium, agrobacterium com a vector de transformació,
transformació per bombardeig, transformació estable envers transient, selecció de les transformants i
regulació de l'expressió del transgen (constitutiva, específica i promotors induïbles)
-Transformació de plastidis: integració del DNA exogen al genoma del plastidi, vectors i disseny genètic
(marcadors genètics), transformació nuclear envers plastidial, aplicacions.
La segona part de l'assignatura consta de les següents parts:
-Es realitza una primera sessió de coneixements generals, tots ells relacionats amb tècniques o eines
moleculars.
-Es realitza una sessió de bioinformàtica a l'aula d'informàtica de la facultat. Aquesta sessió té com a objectiu
introduir els alumnes en els programes informàtics relacionats amb la biologia molecular. No tractem temes
d'-òmiques.
-Es realitza un exercici de pràctiques a l'aula. Es basa en treballar amb mutants i transgènics. Com fer-los,
quins són apropiats i quins no. Es plantegen fenotips i s'ha de discutir quines alteracions són lògiques i quines
no. Aquest exercici és un bon complement del que han fet a la primera part de l'assignatura.
-Familiarització amb les tècniques debiologia molecular relacionades amb ChIP-Seq, ChIP-QPC, RNA-Seq y
QPCR. Els alumnes treballen en grup i han d'elaborar un experiment.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| seminaris | 16 | 0,64 | |
| estudis autònoms | 90 | 3,6 | |
| classes magistrals | 33 | 1,32 |
Les activitats de formació inclouen els següents elements:
- Conferències. Es realitzaran classes presencials d'aula que desenvolupen els continguts teòrics.
- Resolució de casos pràctics. S'analitzaran detingudament casos d'estudi procedents d'articles d'investigació recents.
- Sessions de bioinformàtica en què es presentaran casos pràctics per formar-se en les principals eines de bioinformàtica aplicades
- Preparació i presentació de seminaris per part de cada estudiant en relació amb els continguts del mòdul.
- Les activitats autònomes inclouen la comprensió autònoma i l'estudi dels continguts del mòdul, la recerca bibliogràfica i la preparació
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| treball escrit relacionat amb les classes | 35 | 2 | 0,08 | CA03, CA04, KA03, KA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
| presentació seminari | 25 | 2 | 0,08 | CA03, CA04, KA03, KA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
| preparació de seminaris | 20 | 4 | 0,16 | CA03, CA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
| actitud proactiva, participació a classe, rigor científic en les discussions, etc | 20 | 3 | 0,12 | CA03, CA04, KA03, KA04, SA05, SA06, SA07, SA08 |
L'avaluació d'aquest mòdul es basarà tant en una avaluació continuada, per tal d'estimular els esforços de l'estudiant a les activitats desenvolupades durant el curs, com en l'entrega de treballs relacionats amb els conceptes tractats. L'assignatura s'aprovarà a partir d'un cinc sobre 10.
En aquesta assignatura es permet l'ús de tecnologies d'Intel·ligència Artificial (IA) com a part integrant del desenvolupament del treball, sempre que el resultat final reflecteixi una contribució significativa de l'estudiant en l'anàlisi i la reflexió personal. L'estudiant haurà d'identificar clarament quines parts han estat generades amb aquesta tecnologia, especificar les eines emprades i incloure una reflexió crítica sobre com aquestes han influït en el procés i el resultat final de l’activitat. La no transparència de l’ús de la IA es considerarà falta d'honestedat acadèmica i pot comportar una penalització en la nota de l'activitat, o sancions majors en casos de gravetat.
La realització de qualsevol irregularitat en un acte d’avaluació (frau acadèmic, plagi o ús indegut de la IA, tret que aquest ús estigui autoritzat expressament a la guia docent), que pugui conduir a una variació significativa de la qualificació, suposa que aquest acte es qualificarà amb un 0. En cas que la guia docent prevegi que per superar l’assignatura sigui requisit imprescindible haver obtingut una nota mínima en aquest acte d’avaluació o que es produeixin diverses irregularitats en els actes d’avaluació d’una mateixa assignatura, la qualificació final d’aquesta assignatura és 0. Al marge d’això, es podrà instruir un procés disciplinari a l’estudiant que incorri en alguna d’aquestes irregularitats.
Bibliografia
Tota la bibliografia recomanada està disponible a la biblioteca de la UAB.
- Biotechnology and plant disease management. Editor(s): Z.K. Punja, S.H. De Boer and H. Sanfaçon.
Wallingford: CABI, 2007, ISBN: 9781845932886.
- Handbook of Plant Biotechnology Online. Editors-in-chef Paul Christou, Harry Klee. John Wiley and Sons,
2005. Online ISBN: 9780470869147; DOI: 10.1002/0470869143.
- Plant Biochemistry (Fourth Edition). Editor(s): Hans-Walter Heldt and Birgit Piechulla. London Academic,
2010. ISBN 9780123849861.
- Plant Biotechnology: Current and Future Applications of Genetically Modified Crops. Editor(s): Nigel G.
Halford. John Wiley & Sons, 2006, Print ISBN: 9780470021811, Online ISBN: 9780470021835, DOI:
10.1002/0470021837.
- Plant biotechnology and genetics: principles, techniques, and applications. Editors: C. Neal Stewart. Wiley,
2008. ISBN 9780470043813.
- Plant Biotechnology and Molecular Markers. Editors: P.S. Srivastava, Alka Narula, Sheela Srivastava. Kluwer
Academic Publishers, 2004. ISBN: 978-1-4020-1911-1 (Print) 978-1-4020-3213-4 (Online).
Journals in the area of Molecular Biology and Biotechnology of Plants (the 10 journals with highest impact
factor in the area of \"Plant Sciences\" of the Journal Citation Reports):
- ANNUAL REVIEW OF PLANT BIOLOGY, Publisher: ANNUAL REVIEWS. ISSN:1543-5008.
- TRENDS IN PLANT SCIENCE. Publisher: ELSEVIER SCIENCE LONDON. ISSN: 1360-1385
- ANNUAL REVIEW OF PHYTOPATHOLOGY. Publisher: ANNUAL REVIEWS. ISSN: 0066-4286
- PLANT CELL. Publisher: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS. ISSN: 1040-4651
- CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY. Publisher: CURRENT BIOLOGY LTD. ISSN: 1369-5266
- NEW PHYTOLOGIST. Publisher: WILEY-BLACKWELL. ISSN: 0028-646X
- PLANT JOURNAL. Publisher: WILEY-BLACKWELL. ISSN: 0960-7412
- PLANT PHYSIOLOGY. Publisher: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS. ISSN: 0032-0889
- PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL. Publisher: WILEY-BLACKWELL. ISSN: 1467-7644
- MOLECULAR PLANT. Publisher: OXFORD UNIV PRESS. ISSN: 1674-2052
Tota la informació necessària per a la complementació teòrica de l'assignatura es pot trobar online a través de
les plataformes que la universitat posa a disposició de l'alumnat.
Programari
Els llocs webs que s'utilitzaran es proporcionaran durant el curs.
Grups i idiomes de l'assignatura
La informació proporcionada és provisional fins al 30 de novembre. A partir d'aquesta data, podreu consultar l'idioma de cada grup a través d'aquest enllaç. Per accedir a la informació, caldrà introduir el CODI de l'assignatura
| Tipus de docència | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (TEm) Teoria (màster) | 1 | Anglès | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PAULm) Pràctiques d'aula (màster) | 1 | Anglès | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (SEMm) Seminaris (màster) | 1 | Anglès | primer quadrimestre | matí-mixt |