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Biología Sintética

Código: 107533
Créditos: 6
2026/2027
Titulación Tipo Curso
Biotecnología OP 4

Profesor/a de contacto

Nombre :
Marc Torrent Burgas
Correo electrónico :
marc.torrent@uab.cat

Equipo docente

Susanna Navarro Cantero

Idiomas de los grupos

Puede consultar esta información al final del documento.

Prerrequisitos

No hay prerrequisitos para esta asignatura, pero se recomienda haber cursado asignaturas de biología molecular así como química e ingeniería de proteínas.

Objetivos

La asignatura tiene como objetivo introducir al estudiante en la Biología Sintética como una materia interdisciplinar que integra la biología molecular, la ingeniería genética, la química, y la biología omputacional. A través de clases teóricas, prácticas y un proyecto de investigación, se busca que el estudiante adquiera las herramientas conceptuales y experimentales necesarias para:

  1. Comprender los fundamentos de la biología sintética y su distinción respecto a la ingeniería genética tradicional.

  2. Diseñar y analizar circuitos genéticos, ordenadores biológicos y sistemas de regulación molecular.

  3. Conocer estrategias para el diseño de genomas, proteínas y rutas metabólicas de novo mediante modelos computacionales e inteligencia artificial.

  4. Aplicar estos conocimientos en la creación de organismos con nuevas funcionalidades, como píldoras vivas, biosensores y bacterias terapéuticas.

  5. Reflexionar sobre los aspectos éticos, legales y sociales de la biología sintética, incluyendo el biohacking, los humanos aumentados y la modificación del código genético.

Resultados de aprendizaje

  • CM25 (Trabajar en equipo y de forma colaborativa para la resolución de problemas en el ámbito de la biología de sistemas.) Trabajar en equipo y de forma colaborativa para la resolución de problemas en el ámbito de la biología de sistemas.
  • KM27 (Determinar el impacto medioambiental que supone el uso de la biología sintética en la producción biotecnológica.) Determinar el impacto medioambiental que supone el uso de la biología sintética en la producción biotecnológica.
  • SM23 (Utilizar los fundamentos de matemáticas, física y química necesarios para el estudio de los mecanismos de regulación a nivel molecular en los seres vivos.) Utilizar los fundamentos de matemáticas, física y química necesarios para el estudio de los mecanismos de regulación a nivel molecular en los seres vivos.
  • SM24 (Modelizar de forma cuantitativa un proceso o sistema biológico.) Modelizar de forma cuantitativa un proceso o sistema biológico.

Contenidos

I. Introducción a la Biología Sintética


Módulo 1: Fundamentos de la Biología Sintética


Definición y ámbito de estudio.

Historia y evolución de la biología sintética.

Diferencias con la ingeniería genética tradicional.

Impacto en la biotecnología y la biomedicina.

Objetivos y desafíos de la biología sintética.


II. Diseño Biológico


Módulo 2: Circuitos Biológicos y Computadores Moleculares


Fundamentos de los circuitos genéticos.

Regulación génica: promotores, represores y otros elementos.

Estrategias para la modularidad y la reconfiguración de circuitos.

Interruptores genéticos, osciladores y comportamiento biestable.

Regulación transcripcional y post-transcripcional.

Uso de algoritmos evolutivos para la optimización de diseños genéticos.


Construcción de computadores biológicos.

Implementación de compuertas lógicas a nivel celular.

Sensores biológicos y sistemas de detección.

Biocomputación y memoria celular.

Simulaciones y prototipos experimentales.



Módulo 3: Diseño de Organismos Sintéticos


Síntesis de genomas artificiales.

Construcción de genomas mínimos: el caso de Mycoplasma laboratorium.

Protocolos de ensamblaje y síntesis de ADN a gran escala.

Ingeniería de genomas completos con inteligencia artificial.

Optimización de chasis celulares para aplicaciones industriales.


Generación de nuevas enzimas y rutas metabólicas.

Modelos de inteligencia artificial para el diseño de macromoléculas.

Catálisis biológica artificial.

Creación de nuevos productos químicos y farmacéuticos in silico.


Aplicaciones biotecnológicas del diseño de novo.

Diseño de organismos fotosintéticos sintéticos.

Producción de biofármacos y materiales biocompatibles.

Biosensores ambientales.

Organismos sintéticos en bioenergía.



III. Aplicaciones de la Biología Sintética


Módulo 4: Píldoras Vivas y Microorganismos Terapéuticos


Ingeniería de microbiomas terapéuticos.

Microbios como fábricas de fármacos dentro del cuerpo.

Bacterias modificadas para detectar y tratar enfermedades.

Regulación de respuestas inmunológicas mediante microorganismos modificados.

Estrategias para evitar respuestas inmunes adversas.

Legislación y normas de bioseguridad.

Estudios de riesgos y beneficios en humanos.


Módulo 5: Modificación y Expansión del Código Genético


Incorporación de nuevos aminoácidos al código genético.

Bases moleculares de la ingeniería del código genético.

Expansión del código genético. Ortogonalidad. Transferasas de ARNt y sintetasas diseñadas.

Producción de proteínas fluorescentes, catalizadores sintéticos y nuevos materiales.


Consecuencias evolutivas y seguridad de códigos genéticos expandidos.

Efectos a largo plazo en células y organismos.

Biocontención y estrategias para evitar la transferencia horizontal de genes.


Módulo 6: Biohacking, Humanos Aumentados y Ética


Biohacking y experimentación en biología sintética.

Casos emblemáticos de biohacking y comunidades DIYbio.

Limitaciones legales y normativas.


Humanos aumentados e interfaces cerebro-máquina.

Genética de humanos aumentados: posibilidades y límites técnicos.

Capacidades aumentadas: mejora de habilidades físicas (miostatina y FOXP2), cognitivas (regulación de los genes SCN9A y NR2B) y sensoriales (modificación de opsina 1, PDE6H o TMC1).

Creación de bacterias simbióticas para mejorar la digestión de tóxicos o la absorción de nutrientes.

Regulación del envejecimiento, rejuvenecimiento orgánico y transferencia de conciencia.

Interfaces cerebro-máquina y telepatía digital: Aplicaciones de Neuralink, BrainGate, Kernel o NextMind.


Actividades formativas y Metodología

Título Horas ECTS Resultados de aprendizaje
Tutorías en grupo 4 0,16 SM23, SM24
Clases de problemas/temas específicos 10 0,4 CM25, KM27, SM23
Estudio individual 67 2,68 SM23
Proyecto de investigación 12 0,48 CM25, KM27, SM23, SM24
Etudio individual de temas específicos 15 0,6 SM23
Clases de teoría 35 1,4 KM27, SM23, SM24

Sesiones teóricas

Las clases teóricas son una parte esencial de la asignatura y están diseñadas para proporcionar una base sólida y bien estructurada de los contenidos más relevantes. Además de explicar los conceptos clave, el profesor fomentará la participación activa mediante preguntas abiertas, breves debates y ejemplos contextualizados que ayuden a conectar la teoría con casos reales y aplicaciones prácticas. Estas sesiones también ofrecen la oportunidad de interactuar directamente con el profesor y con los compañeros, resolver dudas en tiempo real y consolidar los aprendizajes de forma más dinámica y participativa. Todo el material de clase estará disponible a través del aula Moodle de la asignatura.


Sesiones de problemas

El objetivo de las sesiones de problemas es consolidar los conocimientos teóricos mediante el análisis y la resolución de ejercicios vinculados al contenido del programa. Se combinarán dos modalidades de trabajo:

1. Problemas estructurados. Al final de cada bloque temático se trabajarán problemas cerrados o semiabiertos que permitan comprender y practicar los fundamentos de cada concepto, por ejemplo, el diseño de circuitos genéticos. Este tipo de ejercicios ayuda a identificar dificultades concretas y reforzar la comprensión de las herramientas básicas.

2. Problemas contextualizados y abiertos. A medida que avance la asignatura, se plantearán situaciones más complejas y realistas que requerirán integrar conocimientos, tomar decisiones justificadas y explorar distintas soluciones posibles. Estos problemas se trabajarán en clase en grupos reducidos para fomentar la participación activa, el razonamiento compartido y la discusión crítica. Se valorará tanto el proceso de resolución como la capacidad de argumentar y comunicar las decisiones tomadas.


Tutorías colectivas

Las sesiones de tutoría están concebidas como espacios de orientación y apoyo activo al alumnado. El objetivo principal es ofrecer una guía sobre cómo planificar y abordar de forma eficaz los contenidos que forman parte del aprendizaje autónomo. El profesor proporcionará estrategias para organizar el estudio, identificar los conceptos clave y utilizar los recursos docentes disponibles de forma óptima. Estas sesiones también permitirán resolver dudas generales, compartir dificultades comunes y fomentar la reflexión sobre el propio proceso de aprendizaje.

Nota: se reservarán 15 minutos de una clase dentro del calendario establecido por el centro o por la titulación para que el alumnado rellene las encuestas de evaluación de la actuación del profesorado y de evaluación de la asignatura o módulo.

Evaluación

Actividades de evaluación continuada

Título Peso Horas ECTS Resultados de aprendizaje
Prácticas de laboratorio 25% 0,5 0,02 CM25, SM23, SM24
Presentación oral 10% 0,5 0,02 CM25, KM27, SM23, SM24
Proyecto de investigación 40% 3 0,12 CM25, SM23, SM24
Prueba escrita 25% 3 0,12 CM25, KM27, SM23, SM24

Evaluación continua

La evaluación de la asignatura se basa en cuatro componentes que combinan trabajo individual y colaborativo, aplicación práctica y razonamiento teórico. El objetivo es valorar tanto la comprensión conceptual como la capacidad de integrar y aplicar conocimientos de forma crítica y creativa.


1. Proyecto de investigación (40%)

Cada estudiante desarrollará un proyecto de investigación sobre un tema de biología sintética, propuesto por el propio alumno o por el profesor. Este trabajo deberá integrar los conocimientos adquiridos a lo largo de la asignatura, con especial énfasis en el Bloque II (diseño biológico). El objetivo no es realizar una revisión bibliográfica convencional, sino aplicar los conocimientos para responder a una pregunta científica relevante o abordar una necesidad tecnológica actual.

Los proyectos se presentarán y evaluarán mediante un sistema de revisión por pares (peer review) en el que participará toda la clase. Esta dinámica fomenta el pensamiento crítico y el compromiso colectivo. El profesor responsable también evaluará el trabajo y se reserva el derecho de modificar las cualificaciones si se detectara cualquier sesgo en la revisión. Al final del curso, todos los trabajos se recopilarán en un volumen colectivo con formato de revista digital.

Las entregas no son recuperables.


2. Presentación oral del proyecto de investigación (10%)

Cada grupo presentará de forma oral, en un tiempo aproximado de 10 minutos, el proyecto de investigación realizado en una de las sesiones de clase . Se evaluará la capacidad de argumentación, la claridad expositiva y el trabajo cooperativo.


3. Prácticas de laboratorio (25%)

La asistencia a las prácticas es obligatoria para poder aprobar la asignatura. Las prácticas permiten aplicar las herramientas experimentales asociadas a la biología sintética. La evaluación se basará en un informe individual en el que se analizarán los resultados obtenidos, la metodología empleada y la interpretación de los fenómenos observados. Se valorará la capacidad de análisis crítico, la claridad en la redacción y el rigor científico.


4. Examen escrito (25%)

El examen escrito evaluará la comprensión de los conceptos fundamentales de la asignatura, así como la capacidad de razonamiento e integración de contenidos. Incluirá preguntas tanto conceptuales como aplicadas. Podrá evaluarse cualquier contenido trabajado en clase, en los problemas o en el material de estudio autónomo. Es necesario obtener un mínimo de 4 puntos en el exámen escrito para poder superar la asignatura.

Se considerará superada la asignatura cuando la suma de las calificaciones obtenidas sea igual o superior a 5 puntos sobre 10, siempre que se cumplan los criterios de cada actividad evaluativa.

Para participar en la recuperación, el alumnado debe haber sido previamente evaluado en un conjunto de actividades que representen al menos dos tercios (67%) del peso total de la calificación de la asignatura o módulo. Por tanto, el alumnado obtendrá la calificación de "No evaluable" cuando las actividades realizadas tengan un peso inferior al 67% en la calificación final.


NOTAS:

En esta asignatura, se permite el uso de tecnologías de Inteligencia Artificial (IA) como parte integrante del desarrollo del trabajo, siempre que el resultado final refleje una contribución significativa del estudiante en el análisis y la reflexión personal. El estudiante deberá identificar claramente qué partes han sido generadas con esta tecnología, especificar las herramientas empleadas e incluir una reflexión crítica sobre cómo estas han influido en el proceso y el resultado final de la actividad. La falta de transparencia en el uso de la IA se considerará falta de honestidad académica y puede comportar una penalización en la nota de la actividad, o sanciones mayores en casos de gravedad.


La comisión de cualquier irregularidad en un acto de evaluación (fraude académico, plagio o uso indebido de la IA, salvo que dicho uso esté expresamente autorizado en la guía docente), que pueda conllevar una variación significativa de la calificación, supone que dicho acto se calificará con un 0. En caso de que la guía docente prevea que para superar la asignatura sea requisito imprescindible haber obtenido una nota mínima en ese acto de evaluación, o que se produzcan varias irregularidades en los actos de evaluación de una misma asignatura, la calificación final de dicha asignatura será 0. Al margen de esto, se podrá instruir un proceso disciplinario al estudiante que incurra en alguna de estas irregularidades.



Esta asignatura no contempla evaluación única.

Bibliografía

Lehninger: Principles of Biochemistry. D.L. Nelson & M.M. Cox (2021) 8th edition, W. H. Freeman.

Biobuilder: Synthetic Biology in the Lab.  Natalie Kuldell, Rachel, Bernstein, Karen Ingram & Kathryn Hart (2015) 1st edition, O'Reilly Media

Synthetic Biology: From iGEM to the Artificial Cell.   Manuel Porcar & Juli Peretó  (2014) 1st edition, Springer.

Synthetic Biology (2 Volumes). Robert A. Meyers (2015) 1st edition, Blackwell Verlag GmbH.

An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits, Uri Alon (2019) 2nd edition, Chapman and Hall/CRC.

 

Software

CellDesigner: A modeling tool of biochemical networks (http://www.celldesigner.org)

Grupos e idiomas de la asignatura

La información proporcionada es provisional hasta el 30 de noviembre. A partir de esta fecha, podrá consultar el idioma de cada grupo a través de este enlace. Para acceder a la información, será necesario introducir el CÓDIGO de la asignatura