
Análisis de la Supervivencia
Código: 104867Créditos: 6
| Titulación | Tipo | Curso |
|---|---|---|
| Estadística Aplicada | OB | 2 |
Profesor/a de contacto
- Nombre :
- Amanda Fernandez Fontelo
- Correo electrónico :
- amanda.fernandez@uab.cat
Idiomas de los grupos
Puede consultar esta información al final del documento.
Prerrequisitos
Se deben tener conocimientos de:
- Estadística descriptiva
- Probabilidad
- Inferencia estadística
Además, es recomendable estar cursando o haber cursado la asignatura de Modelos Lineales 1 y tener conocimientos básicos de R.
Objetivos
En esta asignatura se introducirán los conceptos básicos para el análisis de variables aleatorias de supervivencia (o variables aleatorias "time-to-event"): Funciones de supervivencia, riesgo y riesgo acumulado, conceptos de censura y truncamiento, función de verosimilitud y log-verosimilitud para datos censurados con diferentes tipos de censura (derecha, izquierda, en un intervalo, etc.) así como para datos truncados, estimadores no paramétricos de Kaplan-Meier (función de supervivencia) y Nelson-Aalen (función de riesgo acumulado), el test de log-rank, una introducción a los modelos de regresión paramétricos de riesgos proporcionales (PH) y de tiempo de vida acelerado (AFT) con especial interés en los modelos de regresión exponencial y Weibull, y, finalmente, una introducción al modelo semiparamétrico de riesgos proporcionales de Cox. Si hay tiempo suficiente, se introducirán algunos temas más avanzados del análisis de la supervivencia. Las aplicaciones serán principalmente en el ámbito de las ciencias de la salud, pero puede haber ejemplos de otros campos como la economía o la fiabilidad.
Resultados de aprendizaje
- CM12 (Valorar la existencia de desigualdades por razón de género en las bases de datos, para evitar los sesgos en la toma de decisiones automática (algorítmica).) Valorar la existencia de desigualdades por razón de género en las bases de datos, para evitar los sesgos en la toma de decisiones automática (algorítmica).
Contenidos
1. Introducción al análisis de la supervivencia
- Datos de supervivencia: Concepto de censura y truncamiento, definición de los conceptos \"study time\" y \"patient time\", ejemplos, etc.
- Función de supervivencia, función de riesgo y función de riesgo acumulada. Vida residual media.
- Distribuciones clásicas de variables aleatorias de supervivencia: Distribución exponencial, Weibull, Gompertz, log-logística, log-normal, etc.
2. Función de verosimilitud y log-verosimilitud para datos de supervivencia:
- Modelo de censura aleatoria y concepto de censura no informativa.
- Construcción de las funciones de verosimilitud y log-verosimilitud bajo diferentes escenarios de censura y/o truncamiento en los datos de supervivencia.
3. Inferencia no paramétrica para datos de supervivencia con censura por la derecha:
- Estimación de la función de supervivencia (Kaplan-Meier) y de la función de riesgo acumulada (Nelson-Aalen).
- Intervalos de confianza para las funciones de supervivencia y riesgo: Fórmula de Greenwood y transformaciones log y log-log.
- Estimaciones puntuales e intervalos de confianza para el tiempo mediano de supervivencia y otros percentiles.
- Comparación de dos curvas de supervivencia: Las pruebas de Log-Rank y Wilcoxon.
4. Modelos paramétricos para el tiempo de supervivencia: Modelos PH y AFT:
- Modelos de riesgos proporcionales (PH): El modelo de regresión exponencial.
- Modelos de tiempo de vida acelerado (AFT): El modelo de regresión de Weibull.
5. El modelo semi-paramétrico de riesgos proporcionales de Cox:
- Descripción general del modelo.
- Estimación del modelo de regresión de Cox: Concepto de verosimilitud parcial.
- Intervalos de confianza, pruebas de hipótesis y comparación de modelos alternativos.
- Interpretación de las estimaciones de los parámetros del modelo.
- Técnicas de bondad de ajuste en el modelo de regresión de Cox.
Actividades formativas y Metodología
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| Solución de problemas teóricos | 25 | 1 | |
| Resolución de algunos problemas y prácticas de laboratorio en clase | 14 | 0,56 | |
| Realización autónoma de cada práctica de laboratorio | 36 | 1,44 | |
| Sesiones de teoría | 24 | 0,96 | |
| Ampliación de conceptos introducidos en las sesiones de teoria | 30 | 1,2 | |
| Realización de prácticas de laboratorio en el aula | 10 | 0,4 |
Para las actividades autónomas:
- AMPLIACIÓN DE CONCEPTOS: Se deberá completar alguna parte de la asignatura a partir del trabajo personal con bibliografía recomendada (disponible como recurso en línea en la biblioteca).
- REALIZACIÓN DE TRABAJOS DE PRÁCTICAS: Servirá para aplicar los conceptos aprendidos así como para aprender la implementación con el programa R.
- SOLUCIÓN DE PROBLEMAS: Como norma general, NO se publicarán las soluciones a las listas de problemas. Los alumnos pueden proponer al profesor en las sesiones de prácticas la corrección de aquellos ejercicios de problemas que no hayan podido solucionar individualmente. Se espera que los alumnos tengan suficiente autonomía para solucionar la lista de problemas y dirigirse al profesor en caso de dudas o dificultades.
Evaluación
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Primer examen (E1) | 25% | 2 | 0,08 | CM12 |
| Problemas evaluables (P) | 20% | 4 | 0,16 | CM12 |
| Examen de prácticas (EP) | 20% | 2 | 0,08 | CM12 |
| Segundo examen (E2) | 35% | 3 | 0,12 | CM12 |
Ver la versión en Catalán
Bibliografía
- Collett, D. (2015). Modelling Survival Data in Medical Research, 3rd Edition. Chapman & Hall.
- https://bibcercador.uab.cat/permalink/34CSUC_UAB/1eqfv2p/alma991010839836806709
- Hosmer, D., Lemeshow, S. and May, S. (2008). Applied Survival Analysis: Regression Modeling of Time-to-Event Data, 2nd Edition. Wiley.
- https://bibcercador.uab.cat/permalink/34CSUC_UAB/1eqfv2p/alma991001026469706709
- Klein, J. and Moeschberger, M. (2003). Survival Analysis: Techniques for Censored and Truncated Data, 2nd Editon. Springer.
- https://bibcercador.uab.cat/permalink/34CSUC_UAB/1c3utr0/cdi_proquest_miscellaneous_36734173
- Kleinbaum, D. (2012). Survival Analysis: A Self-Learning Text, 3rd Edition. Springer Science.
- https://bibcercador.uab.cat/permalink/34CSUC_UAB/1eqfv2p/alma991010402570806709
- Lee, E.T. and Wang, J.W. (2003). Statistical Methods for Survival Data Analysis, John Wiley & Sons, Inc.
- https://bibcercador.uab.cat/permalink/34CSUC_UAB/1c3utr0/cdi_askewsholts_vlebooks_9780471458555
Software
Las prácticas se realizarán con el programa R.
Grupos e idiomas de la asignatura
La información proporcionada es provisional hasta el 30 de noviembre. A partir de esta fecha, podrá consultar el idioma de cada grupo a través de este enlace. Para acceder a la información, será necesario introducir el CÓDIGO de la asignatura
| Tipo de docencia | Grupo | Idioma | Semestre | Turno |
|---|---|---|---|---|
| (TE) Teoría | 1 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLAB) Prácticas de laboratorio | 1 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |