
Laboratorio Integrado 6
Código: 100923Créditos: 3
| Titulación | Tipo | Curso |
|---|---|---|
| Biotecnología | OB | 3 |
Profesor/a de contacto
- Nombre :
- Nathalia Varejao Nogueira
- Correo electrónico :
- nathalia.varejao@uab.cat
Equipo docente
- Margarida Julià Sapé
- Escarlata Rodriguez Carmona
- Carme Roura Mir
Idiomas de los grupos
Puede consultar esta información al final del documento.
Prerrequisitos
Se recomienda cursar o estar cursando simultáneamente las asignaturas de teoría correspondientes a los contenidos de las prácticas de laboratorio:
Bioinformática
Inmunología
Técnicas Experimentales Avanzadas
Virología
Para poder asistir a las prácticas, es necesario que el alumnado justifique haber superado las pruebas de bioseguridad y de seguridad disponibles en el Campus Virtual, así como conocer y aceptar las normas de funcionamiento de los laboratorios de la Facultad de Biociencias.
Objetivos
El Laboratorio Integrado 6 es la última asignatura de un conjunto de 6 que se distribuyen a lo largo del 6 semestres correspondientes a los tres primeros cursos del Grado en Biotecnología.
Los objetivos formativos de estas asignaturas se centran en la adquisición de competencias en el marco de la formación práctica del alumnado.
Los contenidos se organizan en orden creciente de complejidad y asociados a las necesidades y al avance de los contenidos teóricos del Grado.
El Laboratorio Integrado 6 tiene como objetivos formativos la adquisición de competencias prácticas en 4 contenidos específicos:
- Bioinformática
- Inmunología
- Técnicas Instrumentales Avanzadas
- Virología
Resultados de aprendizaje
- CM24 (Revisar las normas generales de seguridad de un laboratorio de Biotecnología.) Revisar las normas generales de seguridad de un laboratorio de Biotecnología.
- KM23 (Reconocer las principales características microscópicas que distinguen las células procariotas de las eucariotas, y las células animales de las vegetales.) Reconocer las principales características microscópicas que distinguen las células procariotas de las eucariotas, y las células animales de las vegetales.
- KM24 (Describir el fundamento teórico y las técnicas adecuadas para la caracterización estructural y funcional de proteínas y ácidos nucleicos.) Describir el fundamento teórico y las técnicas adecuadas para la caracterización estructural y funcional de proteínas y ácidos nucleicos.
- SM20 (Utilizar las técnicas básicas de manipulación, separación, detección y análisis de proteínas y ácidos nucleicos.) Utilizar las técnicas básicas de manipulación, separación, detección y análisis de proteínas y ácidos nucleicos.
- SM21 (Utilizar las técnicas de cultivos de células procariotas, eucariotas y de manipulación de sistemas biológicos.) Utilizar las técnicas de cultivos de células procariotas, eucariotas y de manipulación de sistemas biológicos.
- SM22 (Utilizar las metodologías analíticas para el ensayo de la actividad biológica de los componentes celulares.) Utilizar las metodologías analíticas para el ensayo de la actividad biológica de los componentes celulares.
Contenidos
La asignatura se estructura en 4 tipos de contenidos:
Bioinformática
3 sesiones de 4 horas, en principio, en el aula de informática.
El alumnado realizará un mini proyecto que consistirá en descubrir un gen nuevo, y caracterizarlo, utilizando herramientas bioinformáticas. Como \"gen nuevo\", entendemos uno que no haya sido previamente anotado.
El alumnado deberá poner en práctica los conocimientos adquiridos en la asignatura de Bioinformática, por ejemplo: estudio de las características de la proteína de partida, búsquedas en bases de datos, y búsquedas avanzadas a BLAST, multialineaments y árboles filogenéticos, predicción de estructura tridimensional, estudio de dominios, comparación y clasificación estructural
Inmunología
3 sesiones de 4 horas de trabajo práctico en el laboratorio que incluirán los siguientes análisis:
Prácticas:
- Separación de células mononucleares con gradiente de densidad.
- Prueba y análisis de proliferación de linfocitos T por citometría de flujo
- Precipitación y aglomeración de inmunoglobulinas del suero.
- Cuantificación de inmunoglobulinas humanas por ELISA.
- Análisis de la función lítica del sistema premium (cálculo CH50)
Técnicas Instrumentales Avanzadas
Son 3 sesiones de 4 horas cada una, donde las dos primeras se harán en el laboratorio y la tercera sesión en el aula de informática.
Prácticas:
1. Microscopia
2. Transformación de un plasmídio
3. Citometría
4. Cálculo CMI (Concentración MínimaInhibitoria)
5. Practicas de ordenador: Análisis de resultados: ImageJ y Flowing Software
Virología
4 sesiones de 4 horas cada una. La sesión del jueves incluye 2 horas en el Servicio de Microscopía de la UAB, y la última sesión de prácticas incluye un seminario en el que el alumnado presenta una de las prácticas realizadas en el laboratorio, junto con el análisis de los resultados obtenidos, así como el examen individual de prácticas.
Prácticas:
1. Cuantificación e inactivación por temperatura de suspensiones víricas.
2. Obtención de lisados víricos: infección y amplificación.
3. Detección de virus en aguas residuales: purificación de genomas víricos e identificación de virus por amplificación específica de genes víricos.
4. Neutralización de virus por anticuerpos.
5. Observación de virus por microscopia electrónica de transmisión.
6. Planteamiento y ejecución de un problema práctico.
Por razones de seguridad, estas prácticas se realizan con bacteriófagos, que no pueden infectar o transducir células de mamífero, y con ácidos nucleicos víricos no infecciosos. Todo el material entregado al alumnado está libre de virus que puedan infectar o transducir mamíferos. En cualquier caso, las técnicas básicas de manipulación en un laboratorio de Virología son comparables a las que se utilizan cuando se trabaja con virus de bacterias o virus de eucariotas y, por lo tanto, los objetivos propuestos se pueden alcanzar perfectamente.
Actividades formativas y Metodología
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| Análisis de resultados y resolución de cuestionarios | 7 | 0,28 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
| Presentación de resultados | 7,5 | 0,3 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
| Dirigidas | 52 | 2,08 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
| Estudio | 6 | 0,24 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
La asistencia a las clases de esta asignatura es obligatoria, ya que implican la adquisición de competencias basadas en el trabajo práctico.
El alumnado se distribuye en 4 grupos de prácticas.
Bioinformática
Las sesiones se impartirán en el aula de informática.
Para la realización de las prácticas, el alumnado trabajará en parejas bajo la supervisión del profesorado responsable.
Durante las tres sesiones de prácticas se llevará a cabo la resolución del miniproyecto propuesto, en el cual el alumnado deberá aplicar las herramientas utilizadas en la asignatura de Bioinformática al descubrimiento y la caracterización de una proteína no anotada. En la resolución de este caso, se espera que el alumnado sea capaz de utilizar correctamente las herramientas informáticas trabajadas, plantear las preguntas adecuadas, elaborar un plan de trabajo y, finalmente, realizar una presentación de síntesis en PowerPoint de la información obtenida, junto con su interpretación.
Inmunología, Técnicas Experimentales Avanzadas y Virología
Clases prácticas de laboratorio y análisis de datos.
El alumnado realiza el trabajo experimental en grupos de 2 a 3 personas y bajo la supervisión del profesorado responsable.
Los protocolos de prácticas y, cuando corresponda, los cuestionarios de respuesta estarán disponibles en el aula Moodle de la asignatura.
Antes de comenzar una sesión de prácticas, el alumnado deberá haber leído el protocolo y conocer, por tanto, los objetivos de la práctica, sus fundamentos y los procedimientos que deberá realizar.
Es necesario haber superado el test de seguridad y bioseguridad en los laboratorios.
En las sesiones de prácticas es necesario llevar:
- El protocolo y, cuando corresponda, el cuestionario.
- Una libreta para recoger la información del trabajo experimental.
- Bata de laboratorio.
- Gafas de protección.
- Rotulador permanente.
- Calculadora.
El calendario de prácticas puede consultarse en la página web de la Facultad de Biociencias.
La distribución del alumnado en los grupos de prácticas puede consultarse en el Espacio del Grado en Biotecnología del Campus Virtual.
Evaluación
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Técnicas Instrumentales Avanzadas. Resolución del cuestionario y trabajo en el laboratorio | 25% | 0 | 0 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
| Inmunología. Resolución del cuestionario, informe y trabajo en el laboratorio. | 25% | 1 | 0,04 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
| Bioinformática: Presentación en power point y trabajo en el aula | 25% | 0 | 0 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
| Virología. Prueba escrita con preguntas test y exposición oral | 25% | 1,5 | 0,06 | CM24, KM23, KM24, SM20, SM21, SM22 |
Bioinformática
La evaluación se realizará mediante la entrega vía Moodle de los resultados obtenidos. El formato será una presentación en PowerPoint. El plazo de entrega será al finalizar la última sesión de prácticas. Este trabajo se presentará al profesorado y al resto del alumnado el último día de clase en una breve presentación (5-10 min) y se colgará en el Campus Virtual.
Esta presentación oral permitirá obtener un 25% de la nota final de la asignatura. De este 25%, el 20% corresponderá a la evaluación del profesorado y un 5% se obtendrá mediante la evaluación entre iguales del trabajo presentado.
Inmunología
La evaluación se basa en dos criterios:
- La resolución individual de un cuestionario escrito con preguntas tipo test y preguntas de desarrollo (60% de la calificación del módulo de Inmunología), que se realizará una vez finalizadas todas las sesiones de laboratorio, en una única prueba para todo el alumnado.
- La elaboración de un informe de cada práctica (extensión máxima de una página por práctica), en el que se describirán, analizarán y discutirán los resultados obtenidos (40% de la calificación del módulo de Inmunología). Este informe deberá entregarse en un plazo máximo de una semana después de la última sesión de laboratorio.
Ambos elementos contribuirán a la obtención del 25% de la calificación global de la asignatura.
Técnicas Experimentales avanzadas
La evaluación se hará mediante la resolución de un informe que el alumnado entregará al profesorado, como máximo 15 días después de la finalización de las prácticas, (20% de la nota global de la asignatura) y se valorará su actitud y trabajo en las distintas sesiones (5% de la nota global de la asignatura).
Virología
La evaluación comprende dos actividades:
- Una prueba escrita individual con preguntas tipo test de cuatro opciones de respuesta (18% de la calificación global de la asignatura).
- Una exposición oral de una de las prácticas experimentales, en la que se valorarán el contenido y la organización de la exposición, la calidad de las diapositivas y la calidad de la comunicación (7% de la calificación global de la asignatura).
Evaluación global de la asignatura.
La asistencia a las actividades programadas para la asignatura Laboratorio Integrado 6 es obligatoria. La ausencia a alguna de las sesiones debe ser justificada. Las ausencias no podrán ser superiores al 20% de las actividades programadas.
Para superar la asignatura es necesario obtener una calificación final igual o superior a 5,0 y obtener un mínimo de calificación de 3,5 en cada grupo de contenidos. El alumnado que no alcancen la calificación mínima en unoomás de los grupos de contenidos recibirán una calificación final máxima de la asignatura de 3,5 puntos sobre 10.
Se considerará que el alumnado obtiene la calificación de No Evaluable cuando haya asistido a menos del 20% de las sesiones programadas.
El alumnado repetidor sólo deberá realizar y ser evaluado de aquellos módulos que no haya superado en la primera matrícula (calificación inferior a 4,0). Para los módulos superados se conservará la nota durante un máximo de tres matrículas.
Evaluación única
El alumnado que se acoja a la evaluación única deberá realizar las prácticas de laboratorio (PLAB) en las sesiones presenciales programadas en el calendario.
La evaluación única consiste en una prueba de síntesis única con preguntas de todos los módulos del Laboratorio Integrado el día programado en el calendario académico. La nota obtenida en la prueba de síntesis es el 72% de la nota final de la asignatura. La actitud durante las prácticas, la asistencia y las actividades de evaluación no recuperables representarán el 28% restante.
Se aplicará el mismo sistema de recuperación que para la evaluación continuada.
La realización de cualquier irregularidad en un acto de evaluación (fraude académico, plagio o uso indebido de la IA, salvo que este uso esté autorizado expresamente a la guía docente), que pueda conducir a una variación significativa de la calificación, supone que este acto se calificará con un 0. En caso de que la guía docente prevea que para superar la asignatura sea requisito imprescindible haber obtenido una nota mínima en este acto de evaluación o que se produzcan varias irregularidades en los actos de evaluación de una misma asignatura, la calificación final de esta asignatura es 0. Al margen de esto, se podrá instruir un proceso disciplinario al estudiante que incurra en alguna de estas irregularidades
Bibliografía
Virología
La bibliografía y los enlaces web están indicados en los protocolos de prácticas o, en su caso, en la Guía Docente de la correspondiente asignatura de teoría.
A. Granoff and R.G. Webster. Encyclopedia of virology (on-line Ed.) Academic Press. London.
(http://www.sciencedirect.com/science/referenceworks/9780123744104)
Para los demàs módulos la bibliografia es el propio guión de las prácticas
Cann, Alan J. 2015. Principles of molecular virology. 6th ed. ISBN 9780128019467. Elsevier Academic Press (https://cataleg.uab.cat/iii/encore/record/C__Rb1949706)
Encyclopedia of virology [Recurs electrònic] / editors in chief B.W.J. Mahy and M.H.V. van Regenmortel Llibre digital a la UAB
(https://www-sciencedirect com.are.uab.cat/referencework/9780123744104/encyclopedia-of-virology)
Software
Programas:
Jalview: https://www.jalview.org/
MEGA X: https://www.megasoftware.net/
Notepad++: https://notepad-plus-plus.org/downloads/ç
Icn3d: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/icn3d/icn3d-3.2.0.zip
PyMol: https://pymol.org/2/
Páginas web y Webservers:
https://services.healthtech.dtu.dk/
https://www.ebi.ac.uk/services
https://search.foldseek.com/search
Inmunologia
No hace falta el uso de programas específicos en esta asignatura.
Virología
No hace falta el uso de programas específicos en esta asignatura.
Técnicas Instrumentales Avanzadas
Image J: https://imagej.nih.gov/ij/
Flowing Software: https://bioscience.fi/services/cell-imaging/flowing-software/
Grupos e idiomas de la asignatura
La información proporcionada es provisional hasta el 30 de noviembre. A partir de esta fecha, podrá consultar el idioma de cada grupo a través de este enlace. Para acceder a la información, será necesario introducir el CÓDIGO de la asignatura
| Tipo de docencia | Grupo | Idioma | Semestre | Turno |
|---|---|---|---|---|
| (PLAB) Prácticas de laboratorio | 431 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLABs) Suport a les pràctiques de laboratori | 431 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLAB) Prácticas de laboratorio | 432 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLABs) Suport a les pràctiques de laboratori | 432 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLAB) Prácticas de laboratorio | 433 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLABs) Suport a les pràctiques de laboratori | 433 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLAB) Prácticas de laboratorio | 434 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |
| (PLABs) Suport a les pràctiques de laboratori | 434 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | tarde |