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Microbiología Anbiental Avanzada
Código: 42937Créditos: 9
| Titulación | Tipo | Curso |
|---|---|---|
| Microbiología Aplicada | OB | 1 |
Profesor/a de contacto
- Nombre :
- Olga Sanchez Martinez
- Correo electrónico :
- olga.sanchez@uab.cat
Equipo docente
- Eloi Parlade Molist
- Antoni Sole Cornella
- Elena Hernandez Del Amo
- Maira Martinez Alonso
Idiomas de los grupos
Puede consultar esta información al final del documento.
Prerrequisitos
Se recomienda a los estudiantes que lleven a cabo una revisión de conceptos básicos de microbiología, así como de aspectos relacionados con la ecología microbiana, la microbiología ambiental y la aplicación de técnicas moleculares en estas disciplinas.
Objetivos
En este módulo se le proporcionarán al estudiante conocimientos teóricos y prácticos sobre metodologías avanzadas para el estudio de los microorganismos en ambientes naturales y artificiales. El aprendizaje y la comprensión de estas metodologias le permitirá adquirir el bagaje necesario para la utilización de los microorganismos en la resolución de problemas medioambientales.
Resultados de aprendizaje
- Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación.
- Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
- Aplicar estrategias y técnicas de muestreo apropiadas para comunidades microbianas en ecosistemas naturales y artificiales.
- Caracterizar poblaciones y comunidades de microorganismos procedentes de muestras ambientales.
- Reconocer el papel de los microorganismos como agentes causales de deterioro.
- Conocer los diferentes bioindicadores y bioensayos basados en microorganismos que permiten valorar impactos ambientales.
- Conocer procedimientos y estrategias basadas en microorganismos para el control de plagas y enfermedades.
- Diseñar estrategias de biorremediación y de biorrecuperación basadas en la utilización de microorganismos.
- Utilizar y gestionar información bibliográfica y recursos informáticos relacionados con la microbiología y ciencias afines.
- Utilizar terminología científica para argumentar los resultados de la investigación y saber comunicarlos oralmente y por escrito.
Contenidos
1. Conceptos básicos sobre diseño experimental para el estudio de comunidades microbianas
2. Análisis del biotopo y la biocenosis
3. Modelos experimentales de laboratorio para el estudio de comunidades microbianas
4. Microscopía óptica y electrónica aplicada a la microbiología ambiental
5. Ecología microbiana molecular
6. Análisis del impacto de la actividad humana sobre los ambientes naturales
7. Contaminación ambiental y bioremediación
Actividades formativas y Metodología
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| Tutorias de las practicas de aula | 12 | 0,48 | 2, 3, 7, 9, 10 |
| Búsqueda y gestión de la información | 30 | 1,2 | 9, 10 |
| Preparacion de los casos practicos | 30 | 1,2 | 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 |
| Prácticas de aula | 21 | 0,84 | 2, 6, 9, 10 |
| Estudio | 25 | 1 | 2, 3, 5, 6, 7, 10 |
| Preparación de las presentaciones orales | 25 | 1 | 2, 9, 10 |
| Clases de teoría | 12 | 0,48 | 1, 6 |
| Preparacion de los ejercicios de practicas de laboratorio experimentales y de informatica | 15 | 0,6 | 1, 2, 9, 10 |
| Seminarios de expertos | 6 | 0,24 | 1, 6 |
| Prácticas de laboratorio experimentales y de informática | 16 | 0,64 | 1, 2, 3, 9, 10 |
| Lectura de textos | 30 | 1,2 | 1, 6, 7, 9, 10 |
La metodología docente incluye tres tipos de actividades, las cuales se han programado de forma integrada con el propósito de que al final el estudiante adquiera las competencias indicadas en esta guía.
Bloque de teoría
Se impartirán clases de teoría expositivas donde se explicarán los contenidos básicos del módulo.
Seminarios especializados
También se llevarán a cabo seminarios, impartidos por expertos en los distintos ámbitos de la microbiología ambiental.
Bloque de prácticas
Incluye:
Prácticas de laboratorio experimentales: se realizarán diferentes sesiones sobre técnicas de microscopía de alta resolución, tanto óptica como electrónica, para determinar cambios en la biodiversidad y la captación de metales por parte de los microorganismos en procesos de bioreparación de ambientes contaminados.
Prácticas de aula: Se realizarán varias sesiones sobre diseño experimental por la toma de muestras ambientales y la caracterización de la diversidad microbiana en muestras ambientales, así como diversas clases en las que se resolverán diferentes problemas reales o hipotéticos de carácter ambiental. Se utilizará una metodología ABP (aprendizaje basado en problemas), en la que los estudiantes abordarán los casos planteados trabajando en grupos reducidos en el aula.
Por último, se realizarán diferentes exposiciones orales en clase para resolver los problemas planteados.
Prácticas de informática: se llevarán a cabo diversas sesiones en el aula de informática para introducir al estudiante en el tratamiento y análisis informático de datos moleculares para el estudio de la diversidad de las comunidades microbianas y los cambios que éstas experimentan en respuesta a diferentes factores ambientales o actuaciones humanas. Se trabajarán los siguientes aspectos:
1. Selección de cebadores mediante un estudio in silico para llevar a cabo un estudio de diversidad microbiana de un determinado ambiente.
2. Análisis estadístico de perfiles genéticos obtenidos mediante técnicas de fingerprinting.
3. Deteminación de índices de diversidad a partir del perfil genético de la comunidad microbiana.
4. Edición de secuencias y determinación de la afiliación filogenética de las mismas.
En estas actividades prácticas se permite el uso de la Inteligencia Artificial (IA) pero de forma restringida. Así pues, para esta asignatura, se permite el uso de tecnologías de IA exclusivamente en tareas de apoyo, como la búsqueda bibliográfica o de información, la corrección de textos o las traducciones. El estudiante deberá identificar claramente qué partes han sido generadas con esta tecnología, especificar las herramientas utilizadas e incluir una reflexión crítica sobre cómo estas han influido en el proceso y el resultado final de la actividad. La no transparencia del uso de la IA en esta actividad evaluable se considerará falta de honestidad académica y puede acarrear una penalización parcial o total en la nota de la actividad, o sanciones mayores en casos de gravedad.
Evaluación
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Evaluación teórico-práctica | 40 | 3 | 0,12 | 2, 5, 6, 7, 9, 10 |
| Evaluacion de practicas en el aula de informatica | 15 | 0 | 0 | 9, 10 |
| Evaluacion de las clases practicas de aula | 35 | 0 | 0 | 1, 2, 3, 5, 6, 7, 8, 9, 10 |
| Evaluacion de las practicas experimentales de laboratorio | 10 | 0 | 0 | 4, 10 |
Evaluación continua
Las competencias específicas y transversales se evaluarán mediante distintas actividades:
1. Prueba escrita (40%): Se realizará un examen escrito de los contenidos teórico-prácticos. Este examen incluirá preguntas cortas y/o de tipo test.
2. Evaluación del bloque de clases prácticas (60%). Se valorará el trabajo que se realice en el laboratorio y en las aulas, así como la resolución de los ejercicios planteados durante la realización de las prácticas.
Consideraciones finales:
Las clases prácticas no serán recuperables. Los estudiantes que no superen la evaluación teórico-práctica, la podrán recuperar en la fecha programada a tal efecto. Para participar en la recuperación, el alumnado debe haber estado previamente evaluado en un conjunto de actividades el peso de las cuales equivalga a un mínimo de dos terceras partes de la calificación total de la asignatura. Por tanto, el alumnado obtendrá la calificación de "No Avaluable" cuando las actividades de evaluación realizadas tengan una ponderación inferior al 67% en la calificación final.
Para aprobar la asignatura es obligatoria la asistencia a todas las clases teóricas y prácticas, así como a las sesiones de defensa oral de los casos prácticos.
La realización de cualquier irregularidad en un acto de evaluación (fraude académico, plagio o uso indebido de la IA, salvo que este uso esté autorizado expresamente en la guía docente), que pueda conducir a una variación significativa de la calificación, supone que este acto se calificará con un 0. En caso de que la guía docente prevea que para superar la asignatura sea requisito imprescindible haber obtenido una nota mínima en este acto de evaluación o que se produzcan diversas irregularidades en los actos de evaluación de una misma asignatura, la calificación final de esta asignatura es 0. Al margen de ello, se podrá instruir un proceso disciplinario al estudiante que incurra en alguna de estas irregularidades.
Evaluación única
La evaluación única consiste en una única prueba de síntesis en la que se evaluarán los contenidos teóricos yprácticos dela asignatura. La prueba constará de preguntas de respuesta corta destinadas a evaluar si se han alcanzado los objetivos conceptuales de la asignatura, así como preguntas tipo test de opción múltiple y/o verdadero/falso. La nota obtenida en esta prueba de síntesis supondrá el 40% de la nota final de la asignatura. La evaluación única se realizará el mismo día que el examen escrito de la asignatura.
La evaluación del módulo de clases prácticas (de aula y de laboratorio) seguirá el mismo proceso que la evaluación continua. La nota obtenida supondrá el 60% de la nota final de la asignatura. La asistencia al módulo de prácticas es obligatoria en todas las sesiones.
Bibliografía
Será competencia del estudiante la búsqueda y consulta de bibliografía necesaria para el seguimiento y consecuención de la asignatura.
El profesorado asesorará debidamente a los alumnos en este aspecto.
Software
Se utilizarán los programas habituales del entorno Microsoft. Se podrá utilizar algún software más específico de acceso libre y que el alumno buscará en función de sus necesidades para la resolución de ejercicios en el aula de informática.
Grupos e idiomas de la asignatura
La información proporcionada es provisional hasta el 30 de noviembre. A partir de esta fecha, podrá consultar el idioma de cada grupo a través de este enlace. Para acceder a la información, será necesario introducir el CÓDIGO de la asignatura
| Tipo de docencia | Grupo | Idioma | Semestre | Turno |
|---|---|---|---|---|
| (TEm) Teoría (máster) | 1 | Español | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |
| (PAULm) Prácticas de aula (máster) | 1 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |
| (PLABm) Prácticas de laboratorio (máster) | 1 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |
| (SEMm) Seminarios (màster) | 1 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |
| (PLABsm) Suport a les pràctiques de laboratori (màster) | 1 | Catalán/Español | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |