
Bioquímica
Codi: 102662Crèdits: 8
| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| Veterinària | FB | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom :
- Maria Jose Docampo Garcia
- Correu electrònic :
- mariajose.docampo@uab.cat
Equip docent
- Néstor Gomez Trias
- Joaquín Ariño Carmona
- Asier Gonzalez Sevine
- Antonio Casamayor Gracia
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
No hi ha prerequisits oficials, però és convenient que l'alumnat tingui assimilats els principis bàsics de química i bioquímica.
Objectius
Aquesta assignatura ha de permetre a l’alumnat entendre que els processos biològics dels animals tenen una base química i que es poden explicar en aquestes termes.
Ha de entendre les bases estructurals d’aquests processos, així com la relació estructura-funció en els diferents tipus de compostos biològics: glúcids, lípids, proteïnes i àcids nucleics.
Així mateix, ha de conèixer les bases del metabolisme que li permetin entendre els fonaments bioquímics de la fisiologia i la patologia, amb especial èmfasi en les espècies animals d’interès veterinari.
Finalment ha d’entendre les bases moleculars de la transmissió de la informació genètica i la seva regulació.
Els objectius formatius concrets són conèixer i entendre:
- Els elements bàsics de química biològica: grups funcionals, equilibri químic, principis de bioenergètica, cinètica enzimàtica, potencial redox, isòmers i estereoisòmers.
- L’estructura i funció de proteïnes, glúcids, lípids, nucleòtids i vitamines.
- L’estructura dels àcids nucleics i els processos de replicació, transcripció, traducció i regulació de l’expressió gènica.
- El metabolisme energètic de carbohidrats.
- El metabolisme de les reserves lipídiques, lipoproteïnes, colesterol i lípids complexes.
- El metabolisme de compostos nitrogenats: aminoàcids, porfirines i nucleòtids.
- Els mecanismes principals d’integració del metabolisme i les bases moleculars d’adaptacions i alteracions metabòliques.
- Els fonaments i aplicacions de les principals tècniques i metodologies bioquímiques.
Les activitats pràctiques relacionades amb aquesta disciplina es realitzen a l'assignatura Laboratori Integrat.
Resultats d'aprenentatge
- Analitzar, sintetitzar, resoldre problemes i prendre decisions.
- Buscar i gestionar la informació relacionada amb l'activitat professional
- Descriure els principals grups funcionals d'interès biològic i les seves propietats químiques.
- Reconèixer els principals tipus de reaccions orgàniques i aplicar aquests conceptes als processos biològics.
- Explicar els fonaments de les estructures de les principals molècules biològiques.
- Descriure els principis bàsics de cinètica i regulació enzimàtica.
- Distingir els mecanismes de transmissió i regulació de la informació genètica a la cèl·lula.
- Explicar les principals vies metabòliques.
- Integrar els diferents elements metabòlics en una visió global de l'organisme.
- Establir les bases moleculars de diferents processos fisiològics i patològics.
- Identificar els fonaments de la determinació de paràmetres bioquímics d'interès diagnòstic en el laboratori i avaluar-ne la rellevància individual i en perfils en el diagnòstic.
Continguts
PART 1. LA QUÍMICA DELS ÉSSERS VIUS
Tema 1.- Introducció a la química dels éssers vius. Enllaços del carboni: senzills i múltiples. Classificació dels compostos orgànics: grau d'oxidació i grups funcionals d’interès biològic. Isomeria cis-trans. Conceptes de estereoquímica. Enantiòmers. Compostos quirals i la seva importància en els sistemes vius. Diastereoisòmers. Propietats de l’aigua i importància del medi aquós per als organismes vius.
Tema 2.- Hidrocarburs alifàtics i aromàtics. Alcohols, èters, epòxids i fenols. Compostos carbonílics: aldehids i cetones. Àcids carboxílics i els seus derivats: esters, amides, clorurs i anhídrids d'àcid . Compostos orgànics nitrogenats: Amines, amides i nitrils. Compostos heterocíclics amb nitrogen, oxigen i sofre.
Tema 3.- Equilibri químic. Constant d'equilibri. Equilibri àcid-base. pH i solucions reguladores. La seva importància en biologia.
Tema 4.- Conceptes bàsics de termodinàmica. Energies d'enllaç. Energia lliure (Gº) i processos espontanis. Relació entre ΔGº i Keq. L'ATP com a moneda energètica. Bases estructurals del canvi d'energia lliure durant la hidròlisi de l'ATP. Transferència de grups fosfat.
Tema 5.- Reaccions d'oxidació-reducció. Parells redox. Potencials d'elèctrode i predicció de reaccions redox. Equació de Nernst. Importància de les reaccions redox en bioquímica.
Tema 6.- Constituents de les proteïnes: aminoàcids. Estructura i propietats.
Tema 7.- La seqüència aminoacídica de les proteïnes. L’enllaç peptídic. L’estructura primària de les proteïnes. Seqüenciació de pèptids.
Tema 8.- Estructura tridimensional de les proteïnes. Estructura secundària. L’hèlix α i la fulla β. Estructura terciària. Estructura quaternària Dominis estructurals. Conformació nativa i desnaturalització.
Tema 9.- Les proteïnes fibroses. α-queratina, fibroïna i col·lagen
Tema 10.- Les proteïnes fixadores d’oxigen. Estructura de la mioglobina i de l’hemoglobina. El centre d’unió de l’oxigen. Cooperativitat i al·losterisme. Efectors al·lostèrics. Hemoglobines anormals.
Tema 11.- Les proteïnes catalítiques: enzims. Propietats generals. Classificació. Substrats i cofactors. Isoenzims. Catàlisi enzimàtica.
Tema 12.- Cinètica enzimàtica. L’equació de Michaelis-Menten. Significat de Km i Vmax. Efectes del pH i de la temperatura sobre l’activitat enzimàtica. Inhibició enzimàtica. Principals mecanismes de catàlisi.
Tema 13.- Mecanismes de regulació de l’activitat enzimàtica. Regulació de la concentració d’enzim. Enzims al·lostèrics. Modificació covalent reversible. Interacció proteïna-proteïna. Canvis en la localització subcel·lular. Modificació covalent irreversible (proteòlisi).
Tema 14.- Vitamines. Estructura, funció, requeriments i avitaminosis.
PART 2. METABOLISME I REGULACIÓ METABÒLICA
Tema 15.- Estudi de la regulació de les vies metabòliques. Localitzaciódels llocs de regulació. Estudi de les propietats dels enzims implicats. Punts d'encreuament. Elaboració i comprovació d'una teoria de regulació.
Tema 16. Estudi bioquímic dels glúcids. Generalitats. Famílies de monosacàrids. Oligosacàrids naturals. Polisacàrids de reserva i polisacàrids estructurals.
Tema 17.- Glucòlisi. Visió general i fases. Etapes del procés de la formació de piruvat a partir de la glucosa.
Tema 18.- Formació d'acetil CoA a partir del piruvat i cicle dels àcids tricarboxílics. Vies anapleròtiques. Cicle de l'àcid glioxílic. Síntesi i degradació de disacàrids. Vies metabòliques de fructosa i galactosa.
Tema 19.- Oxidació-Reducció i transport electrònic. Potencials redox i canvi d'energia lliure. Ruta del transport electrònic: la cadena respiratòria. Inhibidors. La mitocòndria i la fosforilació oxidativa. Acoblament de la fosforilació oxidativa al transport electrònic. El mecanisme de la fosforilació oxidativa.
Tema 20.- Formació del lactat i gluconeogènesi. Utilització de l'energia pel múscul. La glucòlisi anaeròbica. Destinació del lactat. Gluconeogènesi. Altres precursors. Reaccions distintives de la gluconeogènesi.
Tema 21.- Ruta de les pentoses fosfat. Obtenció de poder reductor. Via de l'àcid glucurònic.
Tema 22.- Metabolisme del glicogen. El glicogen com a forma d'emmagatzematge de la glucosa. La degradació i la síntesi del glicogen i el seu control.
Tema 23.- Estudi bioquímic dels lípids. Àcids grassos. Ceres. Triglicèrids. Fosfoglicèrids. Esfingolípids i glucolípids. Colesterol.
Tema 24.- Oxidació dels àcids grassos. Mobilització de les reserves lipídiques. β-oxidació. Metabolisme dels cossos cetònics.
Tema 25.- Biosíntesi de les reserves lipídiques. Biosíntesi dels àcids grassos saturats. La formació de malonil-CoA. El complex de l'àcid gras sintetasa.
Tema 26.- La biosíntesi del colesterol i derivats. Regulació de la síntesi de colesterol. Àcids biliars i hormones sexuals.
Tema 27.- Digestió i absorció dels lípids. Les lipoproteïnes. Composició i metabolisme.
Tema 28.- Metabolisme dels lípids estructurals. Fosfoglicèrids. Esfingolípids: esfingomielina, cerebròsids i gangliòsids. Cicle del fosfatidil-inositol. Formació d'IP3.
Tema 29.- Degradació d'aminoàcids. Alliberament i eliminació del nitrogen. Desaminació i transaminació. Cicle de la urea.
Tema 30.- Catabolisme dels esquelets carbonats dels aminoàcids. Aminoàcids cetogènics i gluconeogènics. La integració de les cadenes en les diferents rutes metabòliques. Aminoacidpaties. La reserva de grups monocarbonats, la seva relació amb el metabolisme d'aminoàcids i la seva regulació: derivats de l'àcid fòlic i de la S-adenosilmetionina.
Tema 31.- La fixació de nitrogen, visió general de la biosíntesi d'aminoàcids i la seva regulació. Aminoàcids essencials i no essencials.
Tema 32.- Estructura i metabolisme dels nucleòtids. Biosíntesi de nucleòtids: purines i pirimidines. Biosíntesi dels desoxiribonucleòtids. Degradació de purines i pirimidines.
Tema 33.- Integració del metabolisme.
PART 3. REPLICACIÓ, TRANSCRIPCIÓ, TRADUCCIÓ I LA SEVA REGULACIÓ
Tema 34.- Els àcids nucleics. El DNA i la seva estructura. L’equivalència de bases. La doble hèlix. Nucleosomes.
Tema 35.- El DNA: paper genètic i replicació. Replicació semiconservativa. DNA polimerases. Fragments d’Okazaki. Replicació del DNA: iniciació, elongació i finalització. Reparació del DNA
Tema 36.- Transcripció i regulació de l'expressió gènica en procariotes. Promotors de procariotes. Inici i finalització de la síntesi. Operó lactosa.
Tema 37.- Transcripció i regulació de l'expressió gènica en eucariotes. Promotors i enhancers. Factors de transcripció. Modificacions químiques de les histones i el DNA.
Tema 38.- Processament dels mRNA en eucariotes. Introns i splicing. Modificacions post-transcripcionals del rRNA i tRNA.
Tema 39.- El codi genètic. La naturalesa del codi i les seves característiques principals. Els triplets de bases. L’RNA de transferència com a adaptador en la síntesi proteica.
Tema 40.- La síntesi de proteïnes. Activació dels aminoàcids. Característiques de les aminoacil-tRNA sintetases. Direcció de la síntesi. Iniciació, elongació i terminació. Introducció a la síntesi de proteïnes en eucariotes.
SEMINARIS
Tècniques cromatogràfiques.
Electroforesi.
Metabòlits d’interès clínic.
Enzims d’interès clínic.
Metabolisme de porfirines. Porfíries i icterícies.
Senyalització cel·lular.
Aspectes bioquímics de malalties de producció animal
Tècniques del DNA recombinant.
Els continguts teòrics de les parts 1 i 2, així com 7 dels seminaris, corresponen al primer semestre. Els continguts de la part 3 i el darrer seminari corresponen al segon semestre.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Estudi i consulta bibliogràfica | 99 | 3,96 | 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 |
| Classes teòriques | 58 | 2,32 | 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 |
| Preparació de treballs autoaprenentatge | 30,5 | 1,22 | 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 |
| Seminaris i discussió de problemes | 8 | 0,32 | 1, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 |
La metodologia docent utilitzada en aquesta assignatura combina classes de teoria, seminaris i autoaprenentatge actiu per part de l’alumnat sobre temes d’interès.
• Classes de teoria presencials, on el professorat exposa els aspectes més rellevants de cada tema. L’alumnat disposarà del material en el Campus Virtual.
• Seminaris i discussió de problemes amb la presentació, per part del professorat, de temes específics i discussió en grups reduïts. El format serà presencial.
• Treball autònom de l’alumnat (autoaprenentatge), individualment o en grup, per a l'estudi i la preparació de temes proposats pel professorat. Aquest treball implica la cerca i selecció d’informació en diverses fonts científiques. Les presentacions resultants seran públiques, hauran d’incloure material multimèdia i suport TIC, i aniran seguides de la discussió del tema. Les presentacions es realitzaran durant el segon semestre i seran presencials.
En aquesta assignatura es permet l’ús de tecnologies d’Intel·ligència Artificial (IA) com a eina de suport al desenvolupament del treball, sempre que el resultat final reflecteixi una contribució significativa de l’alumnat en l’anàlisi i la reflexió personal. L’alumnat haurà d’indicar explícitament les parts del treball que han estat generades amb el suport d’aquesta tecnologia, especificar-ne les eines utilitzades, i incloure una reflexió crítica sobre com han influït en el procés i en el resultat final. La manca de transparència en l’ús de la IA es considerarà una falta d’honestedat acadèmica i pot comportar una penalització en la qualificació de l’activitat o sancions més greus en casos de gravetat.
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Exàmens parcials | 80% | 2 | 0,08 | 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 |
| Presentació i discussió del treball d'autoaprenentatge. | 20% | 2,5 | 0,1 | 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 |
El sistema d’avaluació s’estructura en dos mòduls:
- Mòdul 1. Teoria i seminaris (80% de la nota final)
- Mòdul 2. Treball d'autoaprenentatge (20% de la nota final)
La qualificació final s’obté a partir de la suma ponderada dels dos mòduls, d’acord amb els criteris que es detallen a continuació.
AVALUACIÓ CONTÍNUA
Mòdul 1. Teoria i seminaris
El sistema d'avaluació consisteix en proves de tipus test amb respostes d'elecció múltiple. Es realitzaran tres proves parcials al llarg del curs, corresponents a les parts descrites als "Continguts de l'assignatura". Cada prova constarà aproximadament de 25 preguntes, incloent continguts tant de teoria com de seminaris.
El pes de cada parcial en la nota final és el següent:
- Parcial 1: 25%
- Parcial 2: 35%
- Parcial 3: 20%
Superació dels parcials en avaluació contínua:
Cada parcial s'avalua de manera independent i es supera amb una nota igual o superior a 5,0. No obstant, és possible compensar un parcial suspès fent la mitjana ponderada amb la nota dels altres parcials i de l'autoaprenentatge, només si es dona alguna d'aquestes condicions:
- Es suspèn un sol parcial amb nota igual o superior a 4,0, o
- Es suspenen dos parcials amb nota igual o superior a 4,5 en tots dos.
Si la mitjana ponderada es igual o superior a 5,0, l'assignatura quedará superada. En cas contrari, l'alumnat haurà d'examinar-se únicamente dels parcials suspesos (aquells amb nota inferior a 5,0) a l'examen final.
Examen final:
L'examen final constarà de proves independents per a cada parcial. L'alumnat només s'examinarà dels parcials no superats. Per superar l'assignatura en aquesta fase:
- Si es recupera un sol parcial: nota mínima de 4,0 en el parcial i mitjana ponderada final igual o superior a 5,0.
- Si es recuperen dos o més parcials: s'admet que un parcial tingui una nota igual o superior a 4,0 si els dos restants tenen una nota mínima de 5,0, o bé que dos parcials tinguin una nota igual o superior a 4,5 si el tercer té una nota mínima de 5,0. La mitjana ponderada final ha de ser igual o superior a 5,0.
L'assignatura no es considerarà superada si:
- Algun parcial té una nota inferior a 4,0.
- Els tres parcials tenen una nota inferior a 5,0.
L'alumnat, independentment de la puntuació obtinguda en les proves parcials, podrà optar a examinar-se de tot el temari a l'examen final per pujar nota. En aquest cas, la nota final serà l'obtinguda en aquest darrer examen.
Es considerarà "No avaluable" l'alumnat que no s'hagi presentat a cap de les activitats avaluables.
Mòdul 2. Autoaprenentatge
S'avaluarà la presentació del treball, valorant tant l'exposició com la capacitat de discussió del tema. Té un pes del 20% en la nota final.
La realització del treball d'autoaprenentatge, així com l'assistència i participació a la seva sessió de presentació, són obligatòries. L'alumnat que no faci la presentació no podrà superar l'assignatura.
AVALUACIÓ ÚNICA
L'avaluació única implica la la superació de dos mòduls, tal com s’indica en la guia docent:
- Mòdul 1 (80%): examen global que inclou tot el contingut teòric, realitzat el mateix dia en que la resta de l'alumnat s'examina del tercer parcial. L'examen de recuperació tindrà lloc en la mateixa data que per a la resta de l'alumnat. Els criteris d’avaluació, així com el pes específic de cada parcial a la nota final son els que consten a la guia docent per a l'avaluació contínua.
- Mòdul 2 (20%): presentació oral i defensa individual d’un treball. L’alumne/a haurà d’assistir a la presentació el dia del seu grup. La seva presentació oral es farà de manera individual el dia de l’avaluació única. Aquesta activitat és obligatòria.
La realització de qualsevol irregularitat en un acte d’avaluació (frau acadèmic, plagi o ús indegut de la IA, tret que aquest ús estigui autoritzat expressament a la guia docent), que pugui conduir a una variació significativa de la qualificació, suposa que aquest acte es qualificarà amb un 0. En cas que la guia docent prevegi que per superar l’assignatura sigui requisit imprescindible haver obtingut una nota mínima en aquest acte d’avaluació o que es produeixin diverses irregularitats en els actes d’avaluació d’una mateixa assignatura, la qualificació final d’aquesta assignatura és 0. Al marge d’això, es podrà instruir un procés disciplinari a l’estudiant que incorri en alguna d’aquestes irregularitats.
Bibliografia
Nelson, D.L., & Cox, M.M. Lehninger Principios de Bioquímica. 7a edición. Ed. Omega. (2018).
Nelson, D.L., & Cox, M.M. Lehninger Principies of Biochemistry. Eighth Edition. (2021).
Stryer, L., Berg, J. M., & Tymoczko, J. L. Bioquímica. 7ª edición. Ed. Reverté. (2013).
Stryer, L., Berg, J., Tymoczko, J & Gatto, G. Biochemistry. Ninth Edition (2019).
Programari
No es fa servir un programari específic
Grups i idiomes de l'assignatura
La informació proporcionada és provisional fins al 30 de novembre. A partir d'aquesta data, podreu consultar l'idioma de cada grup a través d'aquest enllaç. Per accedir a la informació, caldrà introduir el CODI de l'assignatura
| Tipus de docència | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (TE) Teoria | 1 | Català/Castellà | anual | matí-mixt |
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 1 | Català/Castellà | anual | matí-mixt |
| (TE) Teoria | 2 | Català/Castellà | anual | matí-mixt |
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 2 | Català/Castellà | anual | matí-mixt |
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 3 | Català/Castellà | anual | matí-mixt |