
Virología
Código: 101002Créditos: 6
| Titulación | Tipo | Curso |
|---|---|---|
| Microbiología | OB | 2 |
Profesor/a de contacto
- Nombre :
- Antonio Villaverde Corrales
- Correo electrónico :
- antonio.villaverde@uab.cat
Equipo docente
- José Luis Corchero Nieto
- Antonio Villaverde Corrales
- Esther Vazquez Gomez
- Ugutz Unzueta Elorza
Idiomas de los grupos
Puede consultar esta información al final del documento.
Prerrequisitos
Es importante tener un buen nivel de Bioquímica, Biología Molecular, Microbiología, Biología Celular e inmunología.
Objetivos
Los objetivos docentes de la asignatura son proveer al alumnado de conocimientos fundamentales así como habilidades y competencias relacionadas con la biología, estructura, genética y evolución de los virus en el marco de su patogenia y de las posibilidades farmacológicas y de investigación que ofrece la Virología.
Resultados de aprendizaje
- CM09 (Revisar de forma crítica las aportaciones científicas de las mujeres en el estudio de los microorganismos y otras ciencias afines a la microbiología.) Revisar de forma crítica las aportaciones científicas de las mujeres en el estudio de los microorganismos y otras ciencias afines a la microbiología.
- CM10 (Integrar conocimientos y habilidades del campo de la microbiología, trabajando individualmente y en grupos para elaborar y presentar por escrito o de forma oral y pública un trabajo científico ya sea en lengua inglesa como en la lengua propia u otras.) Integrar conocimientos y habilidades del campo de la microbiología, trabajando individualmente y en grupos para elaborar y presentar por escrito o de forma oral y pública un trabajo científico ya sea en lengua inglesa como en la lengua propia u otras.
- KM14 (Indicar las características estructurales de los microorganismos, prestando especial atención a las diferencias entre entidades acelulares, organismos procariotas y eucariotas unicelulares.) Indicar las características estructurales de los microorganismos, prestando especial atención a las diferencias entre entidades acelulares, organismos procariotas y eucariotas unicelulares.
- KM15 (Describir la diversidad metabólica y funcional del mundo microbiano, distinguiendo las características que definen los diferentes grupos taxonómicos.) Describir la diversidad metabólica y funcional del mundo microbiano, distinguiendo las características que definen los diferentes grupos taxonómicos.
- KM16 (Identificar las principales relaciones que establecen los microorganismos entre ellos, con otros seres vivos, con su medio ambiente y en general con el ecosistema, y los métodos para el estudio de estas interacciones.) Identificar las principales relaciones que establecen los microorganismos entre ellos, con otros seres vivos, con su medio ambiente y en general con el ecosistema, y los métodos para el estudio de estas interacciones.
- SM13 (Relacionar los componentes, las estructuras y los procesos genéticos básicos de los microorganismos y entidades replicativas con sus funciones y los diferentes mecanismos ecofisiológicos de adaptación a su entorno.) Relacionar los componentes, las estructuras y los procesos genéticos básicos de los microorganismos y entidades replicativas con sus funciones y los diferentes mecanismos ecofisiológicos de adaptación a su entorno.
- SM14 (Descubrir el papel de los microorganismos como agentes causales de enfermedades en el hombre, animales y plantas y los procesos que se utilizan para su control.) Descubrir el papel de los microorganismos como agentes causales de enfermedades en el hombre, animales y plantas y los procesos que se utilizan para su control.
Contenidos
1. Naturaleza y multiplicación de los virus
El mundo de los virus. Parasitismo estricto, multiplicación y transmisión. La enfermedad vírica y el concepto iceberg. La diversidad vírica y el viroma. La partícula vírica: dimensiones, composición química, morfología y nomenclatura. Funciones de la cápsida; estabilidad y reconocimiento. Composición química, estructura y organización del genoma vírico: genes estructurales y no estructurales. La polaridad del ácido nucleico. El ciclo vírico: fases extra- e intracelulares. Multiplicación vírica: infecciones productivas y no productivas. Expresión secuencial de genes víricos. Virus, elementos genéticos móviles y seres vivos.
2. Los orígenes de la Virología
Las hipótesis sobre el mantenimiento de la vida y la generación espontánea. Los trabajos de Pasteur. Agentes infecciosos microscópicos y postulados de Koch. El siglo XIX: el descubrimiento de los virus. El mosaico del tabaco: el concepto de veneno filtrable. Descubrimiento de los virus animales. El siglo XX: caracterización química, estructural y genética de los virus. Hechos relevantes en la historia de la Virología. La erradicación de la viruela y el riesgo de reemergencia. Aspectos clínicos y biotecnológicos de la Virología. Bioterrorismo.
3. Estructura de las partículas víricas
Morfología de las partículas víricas. Estudio arquitectónico de las partículas víricas: la microscopía electrónica y las reconstrucciones tridimensionales. La difracción de rayos X: nivel de resolución. Arquitectura molecular en las simetrías helicoidal y icosaédrica. Proteínas trans-membrana en las envolturas víricas. Sitios de unión a receptores. Los antígenos víricos y los epítopos B y T. La neutralización y la evasión de la neutralización. Variabilidad genética y epitópica.
4. Genética vírica y genomas víricos
Diversidad de los genomas víricos. Principio de economía y complejidad de los genomas víricos; genes solapados. Genomas segmentados y partidos. Información que codifica el genoma viral. Tipo de genomas víricos y estrategia de expresión génica y replicación para cada tipo; estrategias de regulación temporal. El clon infeccioso. Principios de genética inversa. Virus defectivos.
5. Metodología virológica
Obtención de partículas víricas. El cultivo celular. Cultivos a pequeña y mediana escala. Purificación. Análisis cuantitativo y cualitativo de las partículas víricas. Detección de componentes víricos y aplicaciones en la metodología diagnóstica. El laboratorio de Virología: áreas y distribución. La seguridad biológica. Niveles de contención: P1 a P4. Tratamiento del aire. Tratamiento de efluentes.
6. Principios de taxonomía vírica
Primeras clasificaciones de virus: clasificación de Baltimore de virus animales. El Comité Internacional de Taxonomía de Virus y el sistema de clasificación. Propiedades víricas usadas en taxonomía. Familias de virus animales y virus todavía no clasificados. Cambios de nomenclatura. Los principales patógenos humanos y sus enfermedades.
7. Multiplicación vírica
Reconocimiento celular. Naturaleza y función de los receptores. Internalización. Decapsidación. Paro de la biosíntesis celular. Estimulación de funciones celulares: papovavirusy adenovirus. Síntesis de RNA, DNA y proteínas víricas: secuencias temporales. Efectos citopáticos. Salida de partículas víricas con y sin lisis. Apoptosis. Transformación celular en virus RNA: oncógenos celulares; activación y transducción. Transformación celular en virus DNA: oncogenes y oncoproteínas víricas. Procesado de proteínas víricas. Dianas de fármacos antivirus. El RNA interferente.
8. Patogenia de las infecciones víricas
Virus \"buenos\". Convivencia virus-huésped. Infecciones asintomáticas. Características de las infecciones víricas. Puertas de entrada. Rutas de transmisión: horizontal y vertical. Infecciones localizadas y sistémicas. Diseminación. Viremia. Transmisión nerviosa. Tejidos diana: tropismo. Infecciones agudas y persistentes. Diseminación. Viremia. Transmisión nerviosa. Tejidos diana: tropismo. Infecciones agudas y persistentes. Infecciones latentes. Factores víricos y no víricos que influyen en la patogénesis. Virulencia. Evasión de la respuesta inmune por parte de virus. Inmunopatología.
9. Respuesta a las infecciones víricas y vacunas.
Tipo de vacunas; atenuadas e inactivadas. Bases moleculares de la atenuación. Vacunas de nueva generación. Vacunas recombinantes y péptidos sintéticos. Vacunación con ácidos nucleicos. Nuevos vectores en vacunas. Las vacunas contra la SARS-CoV-2. La inmunidad de rebaño. Respuesta inmune innata y adaptativa. Las células centinela, el complemento, la inflamación, los interferones. Comunicación entre la respuesta innata y la adaptativa. Respuesta inmune adaptativa: humoral y celular. La importancia de la respuesta inmune celular antivírica. El sistema inmune bacteriano CRISPR / Cas.
10. Origen y evolución delos virus
Origen de los virus; teorías regresivas y en favor de un origen celular. Mecanismos de generación de diversidad. Frecuencias de mutación y abundancia relativa de mutantes. Fijación de mutaciones. Replicasas víricas y fidelidad de copia. Variabilidad y evolución en virus RNA y retrovirus. Las cuasiespecies víricas. Evolución y potencial evolutivo. Selección darwiniana y no darwiniana de mutaciones. Efectos fundacionales y cuellos de botella.
11. Nuevas enfermedades víricas y virus emergentes
Aparición de nuevas enfermedades víricas. Salto de huésped y reservorios víricos. Emergencia y reemergencia vírica. Factores medioambientales, sociales y tecnológicos determinantes. Importancia de los vectores artrópodos. La especie humana como huésped terminal. Nuevos virus y virus emergentes humanos. Las fiebres hemorrágicas. El virus Ébola y el virus de la inmunodeficiencia humana. La re-emergencia continua del virus de la gripe.
12. El viroma
El concepto de viroma y métodos de estudio. El viroma del planeta. El efecto iceberg y el proyecto Viroma Humano. Adquisición del viroma en humanos. Transmisión horizontal del viroma. La transmisión horizontal de fenotipos. El holobionte humano. El papel del viroma en la biología del holobionte, en la salud y la enfermedad. El viroma y la sexualidad.
13. Agentes infecciosos peculiares
Los priones: Las proteínas infecciosas. Desarrollo del concepto de prión. El amiloide. Síntesis y procesado de PrPc. Formación de PrPsc y propagación de los priones. Encefalopatías espongiformes: herencia y contagio. Diversidad fenotípica de los priones; las cepas. El \"scrapie\" (temblor) y la encefalopatía espongiforme bovina. Barreras interespecíficas. Las encefalopatías espongiformes humanas: elKuru, el síndrome de Creutzfeldt-Jakob y las enfermedades hereditarias. Los priones en levaduras. Los viroides: estructura y constancia de dominios. Posibles mecanismos de la patogenia. Los Satélites. El virus de la hepatitis delta. Los virofagos.
14. Bacteriófagos
Utilización de bacteriófagos en genética molecular y biotecnología. El \"phage display\". La generación de anticuerpos sin inmunización y la búsqueda de nuevos ligandos. Evolución molecular dirigida. Sistemas de selección de fármacos.
15. Los virus artificiales
Los virus como nuevos nanomateriales manipulables. La terapia génica vírica; rasgos importantes y riesgos biológicos. Productos de terapia génica en el mercado. Virus artificiales como alternativas a la terapia génica vírica. Tipo de virus artificiales y de biomoléculas usadas. Estrategias modulares. Selección de dominios funcionales inspirados en virus. Ejemplos y aplicaciones de los virus artificiales.
Actividades formativas y Metodología
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| Estudio personal | 44 | 1,76 | CM09, CM10, KM16, SM13, SM14 |
| Clases presenciales | 30 | 1,2 | CM10, KM16, SM13, SM14 |
| Preparación de presentación oral y escrita de trabajos | 2 | 0,08 | CM09, CM10, KM14, KM15, KM16, SM13, SM14 |
| Actividades de aprendizaje activo | 15 | 0,6 | CM09, KM15, SM13, SM14 |
| Búsqueda bibliográfica | 28 | 1,12 | CM09, CM10, KM16, SM13, SM14 |
| Lectura de textos | 23 | 0,92 | CM09, CM10, KM16, SM13, SM14 |
| Tutorías personalizadas | 2 | 0,08 | CM10, KM16, SM13, SM14 |
| Trabajo en grupo: preparación de informes escritos | 2 | 0,08 | CM09, CM10, KM14, KM15, KM16, SM13, SM14 |
El curso constará de clases teóricas y actividades de aprendizaje activo con problemas científicos y casos para que los estudiantes adquieran las habilidades necesarias para llevar a cabo búsqueda bibliográfica, proponer enfoques experimentales y diseñar estrategias de resolución de problemas. Las presentaciones orales de actividades de aprendizaje activo fomentarán el trabajo en equipo, la coordinación de las actividades y la presentación racional de los planes de trabajo y resultados. Las actividades de aprendizaje activo se centrarán en los aspectos metodológicos, biomédicos, farmacéuticos, biotecnológicos y las aplicaciones nanotecnológicas de los virus, así como de las estructuras virales derivadas. Se dispondrá de tutorías personales solicitadas por correo electrónico y se llevarán a cabo en el despacho C3/331. En estas sesiones, los estudiantes tendrán la oportunidad de recibir la orientación individual de acuerdo a sus necesidades.
En esta asignatura, se permite el uso de tecnologías de Inteligencia Artificial (IA) como parte integrante del desarrollo del trabajo, siempre que el resultado final refleje una contribución significativa del estudiante en el análisis y la reflexión personal. El estudiante deberá identificar claramente qué partes han sido generadas con esta tecnología, especificar las herramientas empleadas y incluir una reflexión crítica sobre cómo éstas han influido en el proceso y el resultado final de la actividad. La no transparencia del uso de la IA se considerará falta de honestidad académica y puede comportar una penalización en la nota de la actividad, o sanciones.
Evaluación
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Evaluación de 2 actividades en equipo: informes escritos y presentaciónes orales presenciales o gravadas | 30 % | 0 | 0 | CM09, CM10, KM14, KM15, KM16, SM13, SM14 |
| Examen Parcial 2: tipo test | 15 % | 1 | 0,04 | CM10, KM14, KM15, KM16, SM13, SM14 |
| Examen Final: tipo test | 40 % | 2 | 0,08 | CM10, KM14, KM15, KM16, SM13, SM14 |
| Examen Parcial 1: tipo test | 15 % | 1 | 0,04 | CM10, KM14, KM15, KM16, SM13, SM14 |
La evaluación se hará a través de 3 exámenes: dos parciales no eliminatorios y un último examen que comprenderá el tercer parcial y una parte de síntesis o repaso. Los exámenes estarán repartidos durante el curso, con un peso total sobre la calificación final del 70% (15%, 15% y 40% respectivamente). Además, un 30% de la nota se obtendrá por la presentación oral o audiovisual de trabajos y resolución de problemas de aula o presentación de trabajos escritos (en equipo). Para estas actividades (30%) no hay programado un examen de recuperación. Todos los exámenes evaluarán la materia impartida en el período, tanto en las clases teóricas como en los seminarios. Para aprobar la asignatura es necesario obtener al menos un 5 como nota ponderada de los exámenes test. El examen se hará en el idioma en el que se imparte la asignatura.
El examen de recuperación será tipo test y tendrá preguntas de todo el temario. Podrán acceder a él los alumnos que hayan suspendido en la nota global de la asignatura, pero también aquellos que quieran subir nota. Hace falta inscripción previa. No se pueden recuperar exámenes parciales por separado. La recuperación será de toda la asignatura y la nota obtenida será la del examen de recuperación (70%), independientemente de las notas obtenidas en los exámenes previos. En cumplimiento del artículo 112 ter punto 2 de la Normativa Académica vigente de la UAB, para participar en el examen de recuperación, el alumnado debe haber estado previamente evaluado en un conjunto de actividades el peso de las cuales equivalga a un mínimo de dos terceras partes de la calificación total de la asignatura o módulo. Por tanto, el alumnado obtendrá la calificación de \"No evaluable\" cuando las actividades de evaluación realizadas tengan una ponderación inferior al 67% en la calificación final.
Para los alumnos que hayan elegido voluntariamente la evaluación única, esta consistirá en un único examen tipo test en el que se evaluarán los contenidos de todo el programa de teoría y seminarios de la asignatura. La nota obtenida en esta prueba supondrá el 70% de la nota final. La prueba de evaluación única coincidirá en el calendario con la última prueba de la evaluación continuada y se aplicará el mismo sistema de recuperación. La evaluación de los seminarios seguirá el mismo proceso de la evaluación continua y la nota obtenida supondrá el 30 % de la nota final de la asignatura.
La comisión de cualquier irregularidad en una evaluación (fraude académico, plagio o uso indebido de la IA, salvo que dicho uso esté expresamente autorizado en la guía didáctica), que pueda ocasionar una variación significativa en la calificación, implicará que dicha evaluación se calificará con un 0. En caso de que la guía didáctica establezca como requisito indispensable para aprobar la asignatura haber obtenido una calificación mínima en esta evaluación, o que se produzcan varias irregularidades en las evaluaciones de la misma asignatura, la calificación final será de 0. Además, se podrá iniciar un procedimiento disciplinario contra el alumno que cometa cualquiera de estas irregularidades.
Bibliografía
Libros
- Almond, Jeffrey A. & Webster, Robert G. & Granoff, Allan & Almond, Jeffrey A. (1999). Encyclopedia of virology. (2nd ed.) Academic Press
Disponible en línea
- Almond, Jeffrey A. & Webster, Robert G. & Granoff, Allan & Almond, Jeffrey A. (1999). Encyclopedia of virology. (2nd ed.) Academic Press
Disponible en papel en la biblioteca
- Cann, Alan. (2016). Principles of molecular virology. (6th ed.) Academic Press Disponible en línea
- Cann, Alan. (2015). Principles of molecular virology. (6th ed.) Elsevier / Academic Press Disponible en papel en la biblioteca
- Dimmock, N. J. & Leppard, K. N. & Easton, A. J. (2016). Introduction to modern virology. (7th ed.) Wiley Disponible en línea
- Dimmock, N. J. & Leppard, K. N. & Easton, A. J. (2016). Introduction to modern virology. (7th ed.) John Wiley
Disponible en papel en la biblioteca
- Domingo, Esteban. (2020). Virus as populations : composition, complexity, quasispecies, dynamics, and biological implications. (2nd ed.) Elsevier
Disponible en papel en la biblioteca
- Domingo, Esteban. (2016). Virus as populations : composition, complexity, dynamics, and biological implications. (1st ed.) Academic Press
Disponible en línea
- Domingo, Esteban. ([2020]). Virus as populations : composition, complexity, quasispecies, dynamics, and biological implications. (2nd ed.) Academic Press
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- Enquist, Lynn W. [i altres]. (2015). Principles of virology. (4th ed.) AMS Press Disponible en línea
- Flint, S. Jane [i altres]. (2020). Principles of virology. (5th ed.) John Wiley Disponible en papel en la biblioteca
- Fong, I. W. (2017). Emerging zoonoses : A Worldwide Perspective. Springer International Publishing
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- Ippolito, Giuseppe & Rezza, Giovanni. (2017). Emerging and re-emerging viral infections : advances in microbiology, infectious diseases and public health volume 6.Springer
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- Knipe, David M. & Howley, Peter M. (2021-2024). Fields virology. (7th ed.) Wolters Kluwer isponible en papel en la biblioteca
- Pinsky, Benjamin [i altres]. (2016). Clinical virology manual. (5th ed.) ASM Press Pins
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- Quesada, Emilia [i altres]. (2019). Microbiología esencial. Editorial Médica Panamericana Que
Disponible en línea
- Rybicki, Edward P. (2023). Cann's Principles of Molecular Virology. (7th ed.) Academic Press
Disponible en línea
- Tennant, Paula & Foster, Jerome E. & Fermin, Gustavo. (2018). Viruses : molecular biology, host interactions, and applications to biotechnology. Academic Press
Disponible en línea
- Zuckerman, Mark A. & Bamford, Dennis. (2021). Encyclopedia of Virology. (4th ed.) Academic Press
Disponible en línea
Revistas y Bases de datos
- National Library of Medicine (Estats Units d'Amèrica). MEDLINE. National Library of Medicine
Disponible en línea
Software
No hay previsto un programario específico
Grupos e idiomas de la asignatura
La información proporcionada es provisional hasta el 30 de noviembre. A partir de esta fecha, podrá consultar el idioma de cada grupo a través de este enlace. Para acceder a la información, será necesario introducir el CÓDIGO de la asignatura
| Tipo de docencia | Grupo | Idioma | Semestre | Turno |
|---|---|---|---|---|
| (TE) Teoría | 72 | Inglés | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |
| (SEM) Seminarios | 721 | Inglés | segundo cuatrimestre | tarde |