
Bioestadística
Codi: 101965 Crèdits: 6| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| Genètica | FB | 2 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- Marta Coronado Zamora
- Correu electrònic:
- marta.coronado@uab.cat
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Les pròpies d'accés al grau.
És molt convenient tenir uns coneixements matemàtics bàsics per a un bon desenvolupament d'aquesta assignatura.
Objectius
Les eines estadístiques són fonamentals per a la recerca i anàlisi dins de la Genètica i Genòmica. En aquesta assignatura de Bioestadística, no només entendrem i analitzarem dades experimentals sinó també com comunicar resultats estadístics de manera rigorosa i efectiva. Aquesta assignatura introdueix els conceptes bàsics d'estadística, el maneig de dades amb R i les tècniques bàsiques de visualització per representar les dades de manera clara i efectiva.
Els objectius del curs són:
- Desenvolupar el domini dels conceptes bàsics d'estadística.
- Desenvolupar la capacitat d'aplicar aquests conceptes correctament, especialment en els problemes originats en les ciències de la vida i la Genètica.
- Aprendre a comunicar de manera efectiva els resultats d'una anàlisi estadística, tant numèricament com gràficament.
- Obtenir competències bàsiques amb R per a l’anàlisi estadística i la visualització de dades.
Competències
- Aplicació del mètode científic a la resolució de problemes.
- Aplicació dels coneixements teòrics a la pràctica.
- Coneixement i aplicació dels procediments bàsics d’anàlisi estadística i d’aplicacions informàtiques.
- Capacitat per dissenyar estudis experimentals i interpretar resultats.
- Desenvolupament del pensament crític, l’anàlisi i la síntesi.
- Aplicació del llenguatge R per a l’anàlisi estadística.
- Disseny i creació de visualitzacions efectives per a la comunicació de resultats científics.
Resultats d'aprenentatge
- Aplicar el mètode científic a la resolució de problemes.
- Aplicar els coneixements teòrics a la pràctica.
- Descriure i reconèixer problemes associats a comparacions múltiples.
- Dissenyar experiments i interpretar-ne els resultats.
- Elaborar informes de resultats en estudis genètics.
- Identificar i explicar principis de genètica quantitativa.
- Comprendre la importància de la variabilitat i l’aleatorització.
- Formular preguntes de recerca rellevants en genètica.
- Prendre decisions basades en dades.
- Utilitzar paquets estadístics en R.
- Visualitzar dades per comunicar resultats científics.
- Raonar i discutir de manera crítica i científica.
Competències
- Aplicar el mètode científic a la resolució de problemes.
- Aplicar els coneixements teòrics a la pràctica.
- Conèixer, aplicar i interpretar els procediments bàsics del càlcul matemàtic, de l'anàlisi estadística i de la informàtica, la utilització de la qual és imprescindible en genètica i en genòmica.
- Dissenyar experiments i interpretar-ne els resultats.
- Dissenyar i interpretar estudis d'associació entre polimorfismes genètics i caràcters fenotípics per a la identificació de variants genètiques que afecten el fenotip, incloent-hi les associades a patologies i les que confereixen susceptibilitat a malalties humanes o altres espècies d'interès.
- Prendre decisions.
- Raonar críticament.
- Tenir capacitat d'anàlisi i de síntesi.
Resultats d'aprenentatge
- Aplicar el mètode científic a la resolució de problemes.
- Aplicar els coneixements teòrics a la pràctica.
- Descriure els problemes associats a les comparacions estadístiques múltiples.
- Dissenyar experiments i interpretar-ne els resultats.
- Elaborar un informe de resultats d'investigació genètica.
- Enumerar els principis estadístics bàsics de la genètica quantitativa.
- Explicar la lògica del raonament estadístic i la importància de l'aleatorització de causes.
- Plantejar un problema d'investigació genètica.
- Prendre decisions.
- Raonar críticament.
- Tenir capacitat d'anàlisi i de síntesi.
- Utilitzar paquets estadístics.
Continguts
Els continguts que es treballaran inclouen:
- Introducció a la bioestadística. Disseny experimental i inferència estadística. Mostreig: població biològica, població estadística.
- Contrast o prova d'hipòtesis: elements d'una prova estadística.
- Anàlisi estadística d'una o dues mostres: prova t de Student. Comparació de mitjanes. Dades aparellades.
- Anàlisi de la variància I: model d'efectes fixos d'un factor. Procediment de l'anàlisi de variància. Proves a posteriori.
- Anàlisi de la variància II: model d'efectes fixos per a dos o més factors.
- Principis de disseny experimental: unitat experimental i tractament. Variació (error) experimental i el seu control. Repeticions. Potència estadística i mida de l'efecte.
- Anàlisi estadística en regressió.
- Regressió múltiple.
- Anàlisi de la covariància.
- Anàlisi de dades enumeratius.
- Introducció als dissenys en epidemiologia genètica: mètodes de detecció de gens implicats en malalties: lligament i associació.
- Estadística no paramètrica.
A més, es treballarà paral·lelament amb R:
- Introducció al llenguatge R. Importació, manipulació i neteja de dades.
- Visualització de dades amb R (ggplot2).
- Informes reproduïbles amb R Markdown.
- Anàlisis estadístics amb paquets de R.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Clases de teoria | 30 | 1,2 | 3, 4, 6, 7, 8 |
| Pràctiques d'ordinador | 12 | 0,48 | 1, 2, 4, 5, 8, 9, 10, 11, 12 |
| Seminaris de problemes | 11 | 0,44 | 1, 2, 4, 5, 8, 9, 10, 11 |
| Tipus: Supervisades | |||
| Tutories de grup | 4 | 0,16 | 1, 2, 4, 5, 8 |
| Tipus: Autònomes | |||
| Elaboració de treballs | 20 | 0,8 | 1, 2, 5, 10, 11, 12 |
| Hores d'estudi | 60 | 2,4 | 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 |
Els continguts de l'assignatura de Bioestadística s'orienten a proporcionar a l’estudiantat una introducció general als conceptes bàsics de l'estadística per entendre el raonament estadístic i utilitzar adequadament aquestes eines en el disseny i anàlisi d'experiments.
- Classes de teoria: L'alumnat adquireix els coneixements científics propis de l'assignatura assistint a les classes de teoria, que complementarà amb l'estudi personal dels temes exposats. La classe serà dinàmica i interactiva, incorporant eines de participació activa per fomentar la comprensió i reflexió sobre els conceptes exposats.
- Classes de problemes: Els coneixements adquirits en les classes de teoria s'apliquen a la resolució de casos pràctics. Aquestes sessions s’utilitzaran per realitzar demostracions de les anàlisis estadístiques desenvolupades a la teoria.
- Classes de pràctiques amb ordinador: Aquesta part del curs és essencial per consolidar els coneixements adquirits. L’estudiantat aprendrà a utilitzar el llenguatge R i diversos paquets estadístics per implementar les anàlisis vistes a teoria. A més, es treballaran tècniques bàsiques de visualització de dades per comunicar els resultats de manera clara i efectiva.
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, perquè els alumnes completin les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura.
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Proves escrites. Primer parcial | 30% | 2 | 0,08 | 1, 3, 4, 6, 7, 8, 11 |
| Proves escrites. Segon parcial | 40% | 3 | 0,12 | 1, 3, 4, 6, 7, 8, 11 |
| Proves pràctiques | 15% | 1 | 0,04 | 9, 10, 12 |
| Seminaris de problemes | 15% | 7 | 0,28 | 2, 5, 10, 11 |
Les competències d'aquesta matèria seran avaluades mitjançant avaluació contínua, que inclou exàmens escrits, pràctics i els treballs individuals.
El sistema d'avaluació s'organitza en 3 mòduls, cadascun dels quals tindrà assignat un pes específic en la qualificació final.
Teoria
Avaluació mitjançant dues proves parcials. El primer parcial tindrà un pes de 30% i el segon parcial tindrà un pes de 40%. La prova final de recuperació va dirigida als alumnes que no han superat alguna de les proves parcials i el seu pes en la nota final serà el mateix que el de cada parcial.
Problemes
L'avaluació de l'apartat dels problemes es porta a terme mitjançant la realització de problemes curts a classe.
Els alumnes han de resoldre i discutir els problemes davant dels seus companys. Aquest apartat representa el 15% de la nota final de l'assignatura.
Pràctiques
L'avaluació d'aquest apartat es porta a terme mitjançant una prova pràctica a l'aula d'informàtica en sessions d'una hora per a cada grup. En aquesta sessió pràctica, l'alumne ha d'utilitzar el programa estadístic idoni, introduir les dades d'un estudi, proposar una anàlisi del mateix i respondre a preguntes concretes. El pes d'aquesta prova és el 15% de la nota final de l'assignatura.
Els percentatges de problemes i pràctiques s'apliquen amb la condició que l'alumne superi les proves de teoria.
La nota mitjana de l'assignatura es calcula ponderant pels coeficients de cada apartat (teoria, problemes i pràctiques). No obstant això, s'exigeix una nota igual o superior a 4,5 en la segona prova parcial, o en la prova de recuperació percalcular la nota mitjana final. Els alumnes que hagin superat l'assignatura mitjançant les avaluacions parcials i volguessin millorar nota, podrien presentar-se a la prova de recuperació de l'apartat de teoria. L'alumne que es presenti per augmentar nota renúncia a la nota obtinguda en el parcial.
Els alumnes que no hagin participat en l'avaluació continuada i en el lliurament dels treballs de problemes, podran ser avaluats mitjançant la prova final. Així mateix, la seva nota final no pot superar el 70% de la nota màxima.
És necessari obtenir una nota final igual o superior a 5 per superar l'assignatura, mitjançant les proves parcials o de recuperació, en tot cas ponderant amb els apartats de problemes i pràctiques.
Els alumnes repetidors han de dur a terme totes les activitats d'avaluació incloent el lliurament de problemes i l'avaluació de l'examen pràctic.
L'assistència a les sessions pràctiques és obligatòria.
Per participar en la recuperació, l'alumnat ha d'haver estat prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació total de l'assignatura o mòdul. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final.
Avaluació única
L'avaluació única consistirà en un únic examen que inclou tanta teoria (amb un pes del 70%) com a pràctiques d'ordinador (amb un pes del 15%) i pràctiques d'aula (amb un pesdel 15%). Aquesta prova és el 100% de la nota final de l'assignatura.
L'examen per a la valuació única coincidirà amb la data de la prova del segon parcial de la valuació continuada de l'assignatura. La recuperació de l'examen per a la valuació única coincidirà amb l'examen de recuperació de la valuació continuada.
Bibliografia
Llibres
- Grafen, A., & Hails, R. (2002). Modern statistics for the life sciences. Oxford University Press.
- Martínez-González, M. A., Sánchez-Villegas, A., & Faulín Fajardo, F. J. (2006). Bioestadística amigable (2ª ed.). Ediciones Díaz de Santos.
- Sokal, R. R., & Rohlf, F. J. (2013). Biometry: The principles and practice of statistics in biological research (4th ed.). W.H. Freeman and Company.
- Howell, D. C. (2013). Statistical methods for psychology (8th ed.). Wadsworth, Cengage Learning.
- Rodenburg, F. J. (2020). Introduction to biostatistics. https://github.com/FransRodenburg/Biostatistics-Book-Series
- Rodenburg, F. J. (2021). Elements of biostatistics. https://github.com/FransRodenburg/Biostatistics-Book-Series
- Shahbaba, B. (2012). Biostatistics with R: An introduction to statistics through biological data. Springer. https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4614-1302-8
- Marcello Pagano, Kimberlee Gauvreau, Heather Mattie (2022). Principles of biostatistics (3rd ed) Boca Raton, FL: CRC Press
- Vu, J., & Harrington, D. (2023). Introductory statistics for the life and biomedical sciences (Full Color ed.). OpenIntro, Inc.
Programari
S’utilitzarà el programari R i l’entorn de desenvolupament RStudio, emprant paquets específics per a l’anàlisi estadística i la visualització de dades (com ara ggplot2, dplyr, tidyr, entre d’altres). Tot el programari necessari estarà instal·lat i disponible als ordinadors de la facultat.
Grups i idiomes de l'assignatura
La informació proporcionada és provisional fins al 30 de novembre de 2025. A partir d'aquesta data, podreu consultar l'idioma de cada grup a través daquest enllaç. Per accedir a la informació, caldrà introduir el CODI de l'assignatura
| Nom | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 621 | Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 622 | Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 621 | Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 622 | Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 623 | Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (TE) Teoria | 62 | Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |