Biología de Sistemas de las Plantas
Código: 44787 Créditos ECTS: 6| Titulación | Tipo | Curso |
|---|---|---|
| 4318297 Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales / Plant Biology, Genomics and Biotechnology | OT | 0 |
Contacto
- Nombre:
- Ana Montserrat Martin Hernandez
- Correo electrónico:
- anamontserrat.martin@uab.cat
Equipo docente
- Luisa Maria Lois Rojas
- Juan Jose Lopez-Moya Gomez
- Elena Monte Collado
- (Externo) Antoni Gacia-Molina
- (Externo) Iban Eduardo
- (Externo) Jae-Seong Yang
Idiomas de los grupos
Puede consultar esta información al final del documento.
Prerrequisitos
Conocimientos básicos de Genética
Objetivos y contextualización
Proporcionar a los alumnos una visión global y actual de las técnicas, fundamentos y aplicaciones de la
Genómica Vegetal e introducirlos en la Biología de Sistemas de las plantas. Los objetivos específicos incluyen
la comprensión de los siguientes aspectos: la diversidad y complejidad de los genomas vegetales, las técnicas
empleadas habitualmente en los estudios de genómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica y las
aplicaciones a la mejora genética de las plantas cultivadas, así como el uso de las matemáticas para el
modelado predictivo a través de la integración de los datos de las diferentes -ómicas.
Resultados de aprendizaje
- CA12 (Competencia) Utilizar nuevas herramientas bioinformáticas para describir modelos predictivos de datos experimentales ómicos en el ámbito de la Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales.
- CA17 (Competencia) Aplicar la terminología científica para argumentar los resultados de la investigación en mejora genética de plantas de cultivo y comunicarlos oralmente y por escrito en un entorno internacional.
- KA15 (Conocimiento) Describir los resultados de los análisis de datos derivados de estudios proteómicos, y metabolómicos aplicados a la mejora de plantas de cultivo.
- KA16 (Conocimiento) Seleccionar metodologías de estudio en genómica vegetal y estudio de casos prácticos a través de múltiples "omics".
- SA28 (Habilidad) Comunicar los resultados de la investigación en el ámbito de la Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales en inglés oralmente y por escrito utilizando una terminología científica adecuada.
- SA29 (Habilidad) Aplicar los conocimientos de genética molecular y la mejora de las plantas de cultivo en diferentes ámbitos científicos e industriales.
- SA30 (Habilidad) Aplicar los métodos y técnicas empleadas habitualmente en los estudios de genómica, fenómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica.
- SA31 (Habilidad) Aplicar herramientas bioinformáticas al estudio genético, evolutivo y funcional de los vegetales e interpretar los resultados obtenidos de los experimentos realizados.
Contenido
Biología de Sistemas: conceptos, metodología y estudios de casos utilizando múltiples -ómicas. El caso de
estudio será la aparición de una nueva enfermedad que afecta y mata todas las variedades de tomate. Los
estudiantes realizarán un viaje a través de todas las -ómicas para descubrir la causa y buscar una solución
científica viable para su aplicación en la mejora de plantas cultivadas.
Específicamente,
Se utilizarán aplicaciones prácticas de métodos y técnicas en fenómica y genómica vegetales, incluyendo el
uso de marcadores moleculares en la mejora vegetal. Importancia de los QTLs en este problema.
Análisis y aplicación de datos derivados de experimentos de genómica y de transcriptómica para limitar el
problema.
Análisis y aplicación de datos derivados de los experimentos de proteómica, interactómica y metabolómica
para encontrar una solución al problema.
Análisis integrado del caso de estudio aplicados, incluyendo la modelización computacional, para la mejora de
plantas de cultivo.
Actividades formativas y Metodología
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| Tipo: Dirigidas | |||
| Conferencias y charlas de expertos | 12 | 0,48 | |
| Problemas y casos prácticos | 18 | 0,72 | |
| Tipo: Supervisadas | |||
| Preparación de informes | 35 | 1,4 | |
| Tipo: Autónomas | |||
| Estudio Personal | 84 | 3,36 |
Conferencias y charlas de expertos
Problemas y casos prácticos
Preparación de informes
Estudio personal
Nota: se reservarán 15 minutos de una clase dentro del calendario establecido por el centro o por la titulación para que el alumnado rellene las encuestas de evaluación de la actuación del profesorado y de evaluación de la asignatura o módulo.
Evaluación
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Conferencias y charlas de expertos | 10% | 0 | 0 | CA12, CA17 |
| Cuestionario final | 30% | 1 | 0,04 | CA17, SA29, SA30, SA31 |
| Informe | 60% | 0 | 0 | CA17, KA15, KA16, SA28 |
Evaluación continua 10%
Informe 60%
Cuestionario final 30%
Esta asignatura/módulo no contempla el sistema de evaluación única.
Bibliografía
Yunbi Xu Molecular Plant Breeding. CAB International Oxfordshire, UK disponible online a Biblioteca UAB
:http://www.cabi.org/cabebooks/FullTextPDF/2010/20103101750.pdf
Artículos y revisiones específicas recomendados en clase.
Software
MapQTL 6.0
JoinMap 5.0
R
RStudio
Lista de idiomas
| Nombre | Grupo | Idioma | Semestre | Turno |
|---|---|---|---|---|
| (PAULm) Prácticas de aula (máster) | 1 | Inglés | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |
| (TEm) Teoría (máster) | 1 | Inglés | segundo cuatrimestre | manaña-mixto |